心肌梗死后特异性Trem2阳性B细胞亚群生态位的单细胞与整体RNA测序解析

来自GEO数据库的小鼠心肌梗死(scRNA-seq GSE163129和bulk RNA-seq GSE19322)数据揭示：研究人员通过Seurat、SCENIC、Monocle 2等技术，鉴定出具有心脏修复基因Trem2、抗炎因子Il10和心肌重塑分子Spp1的B_Trem2亚型，发现Apoe-Lrp1/Sdc4/Sdc3通路可能激活Spp1表达，为心梗后治疗提供新靶点。

　　

这项研究通过单细胞转录组测序(scRNA-seq)和整体RNA测序(bulk RNA-seq)技术，深入探究了小鼠心肌梗死(MI)后的B细胞亚群特征。科研人员从GEO数据库获取了心梗后小鼠的scRNA-seq数据集(GSE163129)和心肌组织bulk RNA-seq数据(GSE19322)，运用Seurat软件进行细胞分型，结合基因集富集分析、SCENIC转录调控网络分析、Monocle 2伪时序分析和NichNet细胞互作预测等方法。

研究发现心脏梗死区存在12种免疫细胞类型，其中B细胞可细分为5个亚群，包括具有调节性B细胞(Breg)特征的B_Trem2亚型。这个特殊亚群高表达心脏修复关键基因Trem2、抗炎标志物Il10以及心肌重塑相关分子Spp1。值得注意的是，B_Trem2处于B细胞发育终末阶段，并激活了Nfe2l2、Rxrb等转录因子。

机制研究表明，载脂蛋白E(Apoe)可能通过其受体Lrp1、Sdc4和Sdc3促进B_Trem2中Spp1的过表达，从而参与心肌修复过程。该发现为开发靶向Apoe-Spp1信号通路的心梗后治疗策略提供了重要理论依据。