Setipinna属鱼类分类地位重审：基于形态与线粒体COI基因的物种有效性验证及新亚种描述

这篇综述通过整合形态学特征和线粒体细胞色素氧化酶I（COI）基因数据，重新评估了曾被归为Setipinna tenuifilis和S. paxtoni同物异名的多个物种分类地位。研究证实了S. tenuifilis、S. gilberti、S. papuensis和S. paxtoni的独立有效性，并描述新亚种S. gilberti java ssp. nov.，解决了长期存在的分类争议，为印度洋-西太平洋区鱼类生物多样性研究提供关键依据。

　　

引言
Setipinna属（鲱形目Clupeiformes，鳀科Engraulidae）是一类具有独特形态特征的海洋鱼类，其诊断特征包括同时存在腹前和腹后棱鳞、胸鳍丝状延伸、第一上颌骨缺失等。该属目前包含8个有效种，分布于印度洋-西太平洋海域。历史上，多个物种如S. gilberti、S. lighti和S. godavari等曾被归为S. tenuifilis的同物异名，而S. paxtoni的分类地位亦存在争议。本研究通过整合原始描述、模式标本和大量非模式标本的形态数据，结合线粒体COI基因序列分析，对这些物种的分类地位进行了系统性重审。

材料与方法
研究采用标准化形态测量方法，对来自广泛地理分布的标本进行计数和比例测量，包括标准长度（SL）、鳃耙数（UGR/LGR/TGR）等特征。分子分析基于线粒体COI基因648 bp片段，使用最大似然法（ML）构建系统发育树，计算未校正遗传距离。统计方法包括Kruskal-Wallis检验、方差分析（ANOVA）和主成分分析（PCA），以验证物种间的形态差异。

结果
形态与分子数据共同支持四个物种的有效性：

1. S. tenuifilis：分布于孟加拉湾至新加坡，特征为1LGR 12-15，腹棱鳞24-29枚，胸鳍延伸至第10-24根臀鳍起点。
2. S. gilberti：分为两个亚种——
   • S. g. gilberti：西北太平洋种群，1TGR 26-30，胸鳍较短（23.9-36.4% SL）；
   • S. g. java ssp. nov.：印度洋爪哇种群，1TGR 29-30，胸鳍较长（32.5-40.2% SL），与指名亚种遗传距离1%。
3. S. papuensis：新几内亚特有种，背侧呈深黑色，1TGR 26-31，腹棱鳞24-28枚。
4. S. paxtoni：澳大利亚北部种群，50%个体胸鳍为黑色，体高显著（31.3-37.7% SL）。

COI基因分析显示，物种间遗传距离为1.7%-14.7%，其中S. tenuifilis与S. gilberti差异最小（1.7%）。系统发育树支持各物种的单系性（Bootstrap值≥95%）。

分类学修订

• 同物异名处理：S. godavari确认为S. tenuifilis的次定同物异名；S. lighti和Pseudosetipinna haizhouensis归入S. gilberti gilberti。
• 新亚种描述：S. gilberti java ssp. nov.基于爪哇标本建立，其与指名亚种的形态差异体现在鳃耙数、鳍长比例和椎骨数量上。

讨论
研究揭示了Setipinna属的复杂分类历史，澄清了Whitehead等（1988）提出的亚种划分争议。形态差异（如胸鳍长度、体高比例）与分子数据的一致性，为物种划分提供了双重证据。此外，S. paxtoni的黑色胸鳍多态性（50%个体）提示其可能具有尚未研究的生态适应性。

结论
本研究通过多学科证据整合，重新定义了Setipinna属核心物种的分类框架，强调了印度洋-西太平洋海域鱼类多样性的地理隔离效应。未来研究需结合更多基因标记和生态数据，以进一步解析该属的演化历史。