免疫调控lncRNA特征鉴定揭示高级别胶质瘤免疫微环境重编程机制

本研究针对高级别胶质瘤(HGG)免疫抑制微环境(TIME)这一临床难题，通过RCAS-PDGFb和RCAS-BRAF V600E两种小鼠模型，结合单细胞测序和空间转录组技术，首次系统鉴定了14个与免疫表型相关的lncRNA特征。研究发现Meg3/MIAT等lncRNA在免疫抑制性TIME中特异性表达，而Neat1/Mir17hg等与促炎微环境相关，其空间分布特征与GBM患者坏死区域显著相关，为开发靶向lncRNA的免疫治疗策略提供了新靶点。

　　

在儿童和青少年群体中，高级别胶质瘤(HGG)堪称最凶险的脑肿瘤之一，患者确诊后的中位生存期仅12-15个月。这种残酷预后的背后，隐藏着一个狡猾的"帮凶"——肿瘤免疫微环境(TIME)。就像被黑客入侵的计算机系统，HGG的TIME被重编程为高度免疫抑制状态，不仅阻止杀伤性免疫细胞浸润，还主动抑制抗肿瘤免疫应答。传统免疫治疗在此类"冷肿瘤"中屡屡受挫，科学家们迫切需要破解这种免疫抑制的分子密码。

近年来，长链非编码RNA(lncRNA)作为基因调控网络的"暗物质"崭露头角。这些长度超过200nt的RNA分子虽不编码蛋白质，却能通过复杂的二级结构调控基因表达，在染色质重塑、转录调控等层面发挥重要作用。更引人注目的是，lncRNA在黑色素瘤、肺癌等多种肿瘤中显示出调控免疫微环境的能力，包括影响T细胞迁移、髓系来源抑制细胞(MDSC)分化等过程。然而在HGG这一特殊战场，lncRNA如何参与免疫微环境重编程仍是未解之谜。

来自美国的研究团队Alessandro Canella和Prajwal Rajappa选择了两把不同的"钥匙"打开这一黑箱：RCAS-PDGFb模型模拟青少年患者的免疫抑制性HGG，而RCAS-BRAF V600E模型则再现儿童患者中常见的伴随免疫抑制的促炎性HGG。通过整合bulk RNA测序、单细胞RNA测序(scRNA-seq)和空间转录组技术，研究人员系统描绘了HGG免疫微环境中的lncRNA图谱。

关键技术方法包括：1)使用RCAS/t-va转基因小鼠构建PDGFb和BRAF V600E驱动的HGG模型；2)从肿瘤浸润免疫细胞中提取RNA进行bulk测序；3)对免疫细胞亚群进行scRNA-seq分析；4)利用激光显微切割技术分析41例GBM患者的空间转录组数据；5)通过TIMER算法验证lncRNA表达与免疫浸润的相关性。

【Analysis of TIME from different glioma models revealed distinct IncRNA signatures】
研究人员首先通过bulk RNA测序发现，PDGFb模型中有1063个差异表达lncRNA，而BRAF V600E模型中有604个。严格筛选后获得255个(PDGFb)和154个(BRAF V600E)核心lncRNA，其中123个为两者共有。文献挖掘鉴定出14个已知免疫调控lncRNA：MEG3、MIAT等与免疫抑制表型相关，而H19、SNHG6等与促炎表型相关。值得注意的是，PDGFb模型中Meg3表达上调36倍，而在BRAF V600E模型中几乎不表达，这种截然相反的模式提示lncRNA可能作为免疫表型的分子开关。

【Differential expression of immunomodulatory IncRNAs in glioma-associated immune cells】
单细胞解析揭示了更精细的调控图谱：在免疫抑制性HGG中，中性粒细胞表现出广泛的lncRNA下调，而Meg3在免疫抑制性髓系细胞和小胶质细胞中特异性上调。空间分析显示，Meg3、MIAT和SNHG20主要分布在肿瘤边缘，而Pvt1、SNHG12等则富集于坏死区域——这些区域正是免疫抑制的"重灾区"。临床相关性分析发现，SNHG6低表达的GBM患者预后显著较差，为lncRNA的临床意义提供了直接证据。

研究结论指出，特定lncRNA的表达模式与HGG免疫表型存在明确关联：1)免疫抑制性TIME特征性上调Meg3/MIAT/Malat1，下调Neat1/Mir17hg；2)促炎性TIME中Mir17hg/Mir142hg表达升高；3)SNHG6等lncRNA的表达水平与患者生存显著相关。这些发现为理解HGG免疫逃逸提供了新视角，特别是揭示了lncRNA可能通过调控髓系细胞分化(如MDSC)、T细胞功能耗竭等机制塑造免疫抑制微环境。

该研究的突破性意义在于首次建立了HGG免疫微环境与lncRNA表达的特征性关联图谱，为开发靶向lncRNA的联合免疫治疗策略奠定了理论基础。研究者建议未来可采用反义寡核苷酸(ASO)或CRISPR技术调控关键lncRNA，如沉默MEG3以减轻免疫抑制，或增强NEAT1表达以促进抗肿瘤免疫。这种"重编程"免疫微环境的策略，有望打破HGG对当前免疫治疗的抵抗困局，为改善这类难治性肿瘤的临床预后带来新希望。相关成果已发表在《Cancer Gene Therapy》期刊。