古菌超级门DPANN起源于自由生活的广古菌样祖先:系统基因组学证据

【字体: 时间:2025年06月18日 来源:Nature Microbiology 20.5

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  研究人员通过126个高度保守的蛋白标记物和覆盖11个已知DPANN门的深度系统基因组学分析,解决了该古菌超级门的单系性争议及其在古菌树中的演化地位问题。研究证实DPANN为广古菌门(Euryarchaeota)内单系分支,并揭示其可能通过从Patescibacteria等细菌获得水平转移基因而发展出附生生活方式。

  

这项突破性研究运用系统基因组学(phylogenomics)手段,对神秘的古菌超级门DPANN展开了抽丝剥茧般的溯源。通过精心挑选的126个保守蛋白标记和涵盖全部11个DPANN门的样本,科学家们像拼图大师般重建了它们的演化轨迹。

分析结果像探照灯般清晰显示:这些以附生(episymbiotic)生活方式闻名的微生物,其实都源自广古菌门(Euryarchaeota)的同一个祖先分支。特别有趣的是,研究团队发现最早分化的DPANN成员——阿尔提古菌门(Altiarchaeota)仍保持着自由生活的能力,这就像找到了连接两种生活方式的"缺失环节"。

更令人惊叹的是,这些"基因侦探"还发现了DPANN从Patescibacteria和Omnitrophota等细菌"邻居"那里获得的遗传"礼物"。这些水平转移基因(HGT)就像进化工具箱里的关键零件,可能帮助DPANN成功转型为附生专家。整个研究就像一部微生物界的《起源故事》,揭示了从自由生活到依附共生的精彩进化剧本。

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