揭示midnolin-蛋白酶体通路的结构基础及其在多发性骨髓瘤中的抑癌机制

【字体: 时间:2025年06月18日 来源:Molecular Cell 14.5

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  这篇突破性研究通过冷冻电镜(cryo-EM)解析了midnolin-蛋白酶体复合物的三维结构,首次阐明其通过非泛素化途径降解核蛋白的分子机制。研究发现midnolin通过Ubl结构域与PSMD14/Rpn11结合,利用Catch结构域选择性捕获转录因子(如IRF4),并揭示其αHelix-C的核定位序列(NLS)与PSMD2/Rpn1的互作将降解活性限定在细胞核内。更重要的是,该研究证实midnolin下调通过稳定致癌因子IRF4驱动多发性骨髓瘤(MM)进展,为靶向该通路治疗血液肿瘤提供了新思路。

  

Structural basis for the midnolin-proteasome pathway and its role in suppressing myeloma

研究背景
蛋白质选择性降解是维持细胞稳态的核心机制,传统认知中26S蛋白酶体主要通过泛素-蛋白酶体系统(UPS)降解泛素化标记的蛋白质。然而,midnolin蛋白的发现揭示了一条全新的非泛素化降解途径——它能直接引导包括IRF4、EGR1、Fos等关键转录因子进入蛋白酶体降解。这一通路在胚胎发育和代谢调控中至关重要,但其分子机制和病理意义长期未知。

midnolin-蛋白酶体复合物的结构解析
通过冷冻电镜技术,研究团队成功捕获了midnolin与26S蛋白酶体结合的两种构象状态:

  • M1状态(3.9 ?分辨率):显示midnolin的Ubl结构域与蛋白酶体亚基PSMD14/Rpn11结合,同时αHelix-C通过富含精氨酸的核定位序列(NLS)与PSMD2/Rpn1的酸性残基(E315/D316/E319)形成静电相互作用。低分辨率密度显示Catch结构域正位于ATP酶环入口上方,形成"投递位点"。
  • M2状态(3.1-3.4 ?):仅保留αHelix-C与PSMD2的结合,ATP酶环呈现主动转运底物构象,证实了降解过程中的动态构象变化。

特别值得注意的是,Ubl结构域与PSMD14的结合方式与泛素链被切割时的构象高度相似,但在此过程中PSMD14的锌指结构域仅作为"受体"而非酶发挥作用。

核定位与活性的空间调控
研究发现midnolin的αHelix-C具有双重功能:

  1. 其NLS序列被importin β家族蛋白(如TNPO1)识别,通过竞争性结合(亲和力比PSMD2高50倍)阻止midnolin在胞质中与蛋白酶体结合
  2. 进入细胞核后,高浓度Ran-GTP促使importin释放midnolin,使其NLS转而结合PSMD2的"M位点"(含关键残基E319/L426/Y434)

这种精巧的"双锁机制"确保midnolin仅降解已完成核定位的靶蛋白,避免错误降解胞质蛋白。

底物识别的分子密码
通过2.5 ?分辨率的晶体结构,团队破解了EGR1与Catch结构域结合的"FG拉链"机制:

  • Catch结构域形成β折叠,与底物多肽链形成反平行互补
  • 交替的苯丙氨酸(F)和甘氨酸(G)形成疏水核心(如midnolin的F280与EGR1的F145互作)
  • 工程化改造证明,将IRF4的V216突变为Y、NeuroD1的I279突变为Y均可显著增强与midnolin的结合

更有趣的是,通过交换midnolin和EGR1的FG拉链残基(如将Catch的GxFxG突变为FxGxF),成功重编程了底物特异性,为设计新型降解工具奠定基础。

多发性骨髓瘤的治疗新靶点
临床数据分析揭示:

  • midnolin mRNA在MM患者CD138+
    浆细胞中下调4-5倍,且在癌前病变(MGUS/SMM)阶段已出现
  • CRISPRa激活midnolin表达可使IRF4蛋白水平降低70%,显著抑制AMO-1等骨髓瘤细胞系增殖
  • 关键验证:表达不能结合midnolin的IRF4(F220D)突变体能完全逆转生长抑制

这些发现不仅阐明midnolin下调是MM的早期驱动事件,更提示通过小分子恢复midnolin活性或阻断IRF4-midnolin相互作用界面可能成为治疗策略。

研究展望
该研究开创性地描绘了midnolin-蛋白酶体通路的分子蓝图,提出PSMD14可作为非泛素化降解的通用受体。未来研究可关注:

  1. 其他Ubl结构域蛋白是否采用类似机制
  2. midnolin在神经退行性疾病中的作用
  3. 开发稳定midnolin或阻断IRF4的
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