台湾首次报道：Geranium aralia叶斑病病原体——Xanthomonas euvesicatoria pv. polysciadis Pgu1PT 菌株全基因组解析

来自台湾的研究人员针对Xanthomonas euvesicatoria pv. polysciadis（一种新发现的引起Polyscias guilfoylei叶枯病的病原菌）基因组数据缺失的问题，采用PacBio Sequel平台完成其模式菌株Pgu1PT 的全基因组测序。该菌株基因组包含5.13 Mb染色体和53.8 kb质粒（GC含量分别为64.8%和62.1%），注释出4,171个蛋白编码基因。研究填补了该病原体在Araliaceae植物致病机制研究的基因组空白，为植物病害防控提供新靶点。

　　

在植物病原菌研究领域，一项突破性进展揭示了Xanthomonas euvesicatoria（野油菜黄单胞菌）的新致病型。科研团队采用第三代测序技术PacBio Sequel，成功解析了引起Polyscias guilfoylei（俗称geranium aralia）叶斑病的病原体——Xanthomonas euvesicatoria pv. polysciadis模式菌株Pgu1^PT
的完整基因组。

该菌株分离自2020年台湾台中地区的染病叶片，通过经典微生物学方法（营养琼脂NA培养）结合现代分子技术（酚-氯仿DNA提取）获得高质量基因组DNA。测序数据经hifiasm组装和Canu抛光后，获得5,129,423 bp的环状染色体（GC含量64.8%）和53,818 bp的环状质粒（GC含量62.1%）。BUSCO评估显示基因组完整度高达99.5%，注释发现4,171个蛋白编码基因及94个RNA基因。

值得注意的是，比较基因组分析显示其与X. euvesicatoria pv. perforans CFBP 7293菌株的DNA-DNA杂交预测值（dDDH-d4）达88.6%。该研究不仅首次提供了感染五加科（Araliaceae）植物的X. euvesicatoria基因组蓝图，更为开发针对该植物病害的分子检测技术奠定了数据基础。研究获得台湾教育部高等教育深耕计划特色领域研究中心的资助。