沙特进口牛肉中多重耐药性大肠杆菌O13/O129:H11基因组测序及其与志贺氏菌抗原关联性研究

来自沙特食品与药品管理局(SFDA)的研究团队针对进口牛肉中分离的多重耐药大肠杆菌O13/O129:H11(EC190602)开展基因组测序研究。该菌株对5类抗生素耐药，其O抗原与致痢疾的福氏志贺氏菌(S. flexneri)高度相似，为食源性病原体防控提供重要分子依据。

　　

在沙特阿拉伯从苏丹进口牛肉中分离出一株具有多重耐药特性的大肠杆菌(Escherichia coli)O13/O129:H11，菌株编号EC190602。通过3M Petrifilm选择性培养基和MALDI-TOF质谱鉴定后，发现其对甲氧苄啶/磺胺甲恶唑、四环素等5类抗生素呈现耐药性，符合CLSI和NARMS标准定义的多重耐药(MDR)特征。

全基因组测序采用Illumina Novaseq-6000平台，获得492万bp基因组草图，GC含量50.74%，覆盖深度129×。生物信息学分析揭示该菌株属于ST10型，携带fimH27黏附素基因。特别值得注意的是，其O抗原结构与福氏志贺氏菌(S. flexneri)1-5型（尤其是5a型）高度相似，这可能是导致其潜在致病性的关键因素。

基因注释发现大量毒力因子，包括：

• Ⅲ型分泌系统效应蛋白(espX5等)
• 肠杆菌素(enterobactin)合成基因簇(entA-F)
• 脂多糖(LPS)生物合成相关gtrAB操纵子
  耐药基因分析检测到19种多药外排泵基因(mdtA-P)、β-内酰胺酶基因(ampC/TEM-1)及四环素外排泵tet(A)。质粒预测显示携带Col440I_1和IncY_1两种接合质粒，可能介导耐药基因的水平转移。

该研究由沙特食品与药品管理局(SFDA)完成，首次报道了中东地区食品源性的O13/O129:H11型大肠杆菌基因组特征，为理解其与志贺氏菌的进化关系及跨境传播风险提供了重要数据。