DNA甲基化沉默lncRNA PP7080通过调控ANKRD1表达促进胃癌进展的分子机制研究

【字体: 时间:2025年06月18日 来源:Translational Oncology 4.5

编辑推荐:

  本研究针对胃癌(GC)高发病率与死亡率问题,聚焦长链非编码RNA(lncRNA) PP7080的表观遗传调控机制。研究人员通过生物信息学分析、组织样本检测和功能实验,首次揭示DNA甲基化介导的PP7080沉默通过EZH2泛素化和miR-3614-5p海绵效应双重机制调控ANKRD1表达,从而促进GC进展。该研究为GC诊断提供了新型生物标志物,并为lncRNA靶向治疗策略开发奠定理论基础。

  

胃癌作为全球癌症负担的重要贡献者,其高死亡率与缺乏早期诊断标志物、频繁淋巴转移等临床挑战密切相关。尽管长链非编码RNA(lncRNA)在胃癌进展中的作用备受关注,但大多数lncRNA的功能机制仍不明确。无锡市人民医院的研究团队在《Translational Oncology》发表的研究,揭示了lncRNA PP7080通过表观遗传和转录后调控网络抑制胃癌发展的分子机制。

研究采用36对临床样本队列,结合GEO和TCGA数据库分析,通过RNA测序(RNA-seq)、染色质免疫沉淀(ChIP)、双荧光素酶报告基因等技术,系统阐明了PP7080的肿瘤抑制功能。

主要研究结果

  1. lncRNA PP7080在GC中低表达
    通过GSE51575和GSE13911数据集分析发现PP7080在GC组织显著下调,qRT-PCR验证其在27/36例GC组织中表达降低。生存分析显示低PP7080表达患者预后更差,且与低分化程度显著相关。

  2. DNA甲基化介导PP7080表观沉默
    UCSC基因组分析发现PP7080启动子区存在CpG岛和H3K27me3修饰。亚硫酸氢盐测序显示GC细胞中该区域甲基化水平升高,5-氮杂胞苷处理可逆转PP7080沉默,证实DNA甲基化和H3K27me3修饰共同导致其转录抑制。

  3. PP7080的肿瘤抑制功能验证
    过表达PP7080显著抑制BGC823和AGS细胞增殖、迁移(Transwell实验显示侵袭细胞减少40%),诱导细胞凋亡(流式检测凋亡率增加2.1倍)和G2/M期阻滞。裸鼠成瘤实验证实PP7080使肿瘤体积缩小58%,Ki-67表达降低。

  4. ANKRD1作为关键下游靶点
    RNA-seq筛选出21个差异基因,其中ANKRD1(锚蛋白重复蛋白1)表达变化最显著。Western blot显示PP7080过表达使ANKRD1蛋白水平升高3.7倍。挽救实验证实敲低ANKRD1可部分逆转PP7080的抑癌效应。

  5. 核内机制:EZH2泛素化调控
    PP7080与EZH2直接结合,促进其Thr-345/Thr-487位点磷酸化,通过泛素-蛋白酶体途径加速降解(CHX实验显示半衰期缩短至对照组的1/3)。ChIP证实PP7080减少EZH2和H3K27me3在ANKRD1启动子的富集,解除转录抑制。

  6. 胞质机制:ceRNA网络调控
    FISH显示PP7080主要定位于胞质,作为miR-3614-5p"海绵"解除其对ANKRD1 mRNA的抑制。双荧光素酶报告基因验证PP7080和ANKRD1 3'UTR均存在miR-3614-5p结合位点,过表达PP7080使miR-3614-5p水平下降62%。

研究意义
该研究首次阐明DNA甲基化-PP7080-ANKRD1轴在胃癌中的调控网络,提出PP7080通过"核内EZH2泛素化/胞质miRNA海绵"的双重机制上调ANKRD1。临床关联分析显示PP7080和ANKRD1低表达均与不良预后相关,为胃癌诊断提供了潜在的表观遗传标志物。技术层面,研究整合甲基化分析、RNA-protein互作验证和动物模型,为lncRNA功能研究提供范式。未来需开展更大样本临床验证,并探索基于PP7080的液体活检应用价值。

相关新闻
生物通微信公众号
微信
新浪微博
  • 急聘职位
  • 高薪职位

知名企业招聘

热点排行

    今日动态 | 人才市场 | 新技术专栏 | 中国科学人 | 云展台 | BioHot | 云讲堂直播 | 会展中心 | 特价专栏 | 技术快讯 | 免费试用

    版权所有 生物通

    Copyright© eBiotrade.com, All Rights Reserved

    联系信箱:

    粤ICP备09063491号