基因组图谱预测BCR-ABL阴性骨髓增殖性肿瘤克隆演变及预后的创新研究

【字体: 时间:2025年06月18日 来源:Translational Oncology 4.5

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  本研究针对BCR-ABL阴性骨髓增殖性肿瘤(MPN)的克隆演化和预后预测难题,通过对1004例患者进行基因组测序和临床分析,揭示了JAK2、ASXL1等高频突变与疾病表型的关联,构建了包含U2AF1等独立风险因子的预测模型。该研究为MPN精准诊疗提供了分子标志物和新型风险评估工具,具有重要临床转化价值。

  

骨髓增殖性肿瘤(MPN)是一组起源于造血干细胞的克隆性疾病,其中BCR-ABL阴性类型包括真性红细胞增多症(PV)、原发性血小板增多症(ET)和原发性骨髓纤维化(PMF)等。尽管JAK2、CALR和MPL等驱动突变已被明确,但共存突变对疾病进展和预后的影响仍不清楚。随着二代测序技术的普及,越来越多的证据表明,非驱动突变在MPN的异质性和恶性转化中扮演关键角色。然而,目前缺乏大样本研究系统揭示这些突变与临床特征的关联,更缺乏有效的预后预测工具。

山东大学齐鲁医院血液病团队在《Translational Oncology》发表了针对这一问题的里程碑式研究。研究人员对1004例初诊BCR-ABL阴性MPN患者进行了系统性分析,采用38基因panel的靶向测序技术(检测灵敏度1% VAF),结合LASSO回归和Cox模型构建了新型预测工具。研究队列涵盖PV(216例)、ET(478例)、PMF(177例)和未分类MPN(MPN-U,133例),通过长达261个月的随访,揭示了基因组特征与临床预后的深层关联。

主要技术方法包括:1)基于ICC 2022诊断标准的多中心患者招募;2)骨髓/外周血样本的靶向基因测序(Novaseq平台,2500×深度);3)变异等位基因频率(VAF)定量分析;4)LASSO回归筛选预后相关基因;5)构建整合临床和分子特征的列线图预测模型。

研究结果:

  1. 临床特征分析:PMF患者表现出最差的临床指标,包括最高乳酸脱氢酶(LDH,503.5 U/L)、最大脾肿大比例(70.5%)和最低血红蛋白(94 g/L),而MPN-U患者血小板计数最高(470×109
    /L)且血栓事件频发。

  2. 突变谱特征:JAK2 V617F(81.6%)、ASXL1(22.8%)和TET2(14.6%)是前三位高频突变。PMF患者伴随突变数量显著多于其他亚型(74%患者≥2个突变),且EZH2与ETV6突变呈正相关(r=0.23)。三重阴性(TN)患者中NPM1突变率显著高于正常人群(11.04% vs 0.64%,p=0.0076)。

  3. 预后关联:PMF患者5年生存率最低(p<0.0001),JAK2野生型(p=0.0037)和高症状负荷(p<0.0001)提示不良预后。U2AF1突变是独立死亡风险因子,而NF1和ZRSR2突变与AML转化相关。

  4. 克隆演化:追踪发现NF1/ZRSR2克隆扩增伴随PV向AML转化,PPM1D突变克隆出现则与PMF进展为MDS相关。

  5. 预测模型:基于8个基因(JAK2、CALR、U2AF1等)的风险评分模型和整合临床指标的列线图,其5年生存预测AUC达0.821。

结论与意义:
该研究首次在大型队列中系统描绘了BCR-ABL阴性MPN的基因组全景,揭示了三重阴性患者特有的NPM1突变模式,以及U2AF1等新型预后标志物。所构建的预测工具突破了传统临床分期的局限,将分子特征与血小板计数(PLT)、症状负荷等指标有机结合,为个体化治疗决策提供了量化依据。特别值得注意的是,发现JAK2 V617F高突变负荷(VAF≥70%)在ET患者中反而预示更好生存(p=0.0143),这一反直觉现象提示需要重新审视突变负荷的临床意义。

研究还揭示了MPN向AML/MDS转化过程中的关键分子事件:ZRSR2和NF1突变协同驱动白血病转化,而PPM1D突变克隆扩增与MDS进展相关,这些发现为开发干预策略提供了新靶点。尽管存在随访样本量有限等局限,但该研究建立的预测体系已显示出优越的临床适用性,未来通过多中心验证有望改写MPN诊疗指南。

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