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中国鸡源携带blaOXA-10 的肠炎沙门氏菌Mbandaka血清型流行溯源与进化适应研究
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年06月18日 来源:Veterinary Microbiology 2.4
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为解决肠炎沙门氏菌Mbandaka血清型(S. Mbandaka)的全球传播及耐药性威胁,研究人员通过全基因组测序和比较基因组分析,首次在中国鸡源分离株中发现携带blaOXA-10 的多重耐药IncHI2A/IncHI2质粒,揭示了该菌株通过国际贸易和水平基因转移的跨物种传播机制,为防控耐药性扩散提供了关键科学依据。
沙门氏菌感染一直是全球公共卫生和畜牧业的重大挑战,其中肠炎沙门氏菌Mbandaka血清型(Salmonella enterica serotype Mbandaka, S. Mbandaka)因其多重宿主适应性和日益增长的耐药性引发关注。近年来,该菌株在欧美多国引发食源性疾病暴发,但在中国的流行情况尚不明确。更令人担忧的是,抗生素滥用加速了耐药基因(如blaOXA
型β-内酰胺酶基因)在沙门氏菌中的传播,导致临床治疗难度陡增。
为揭示S. Mbandaka在中国的流行特征,四川大学的研究团队对来自26个鸡场的278株沙门氏菌分离株进行全基因组测序(Whole-Genome Sequencing, WGS),首次在死亡鸡肝脏样本中鉴定出携带blaOXA-10
的ST413型S. Mbandaka菌株(YK35)。通过比较基因组学和进化分析,研究人员发现该菌株的IncHI2A/IncHI2质粒与鼠伤寒沙门氏菌(S. Typhimurium)、产气克雷伯菌(Klebsiella aerogenes)等物种的质粒高度同源,证实了耐药基因的跨物种传播。研究还绘制了全球S. Mbandaka的传播路线,指出其可能通过国际贸易从欧美传入中国。相关成果发表于《Veterinary Microbiology》,为耐药性监测和防控策略提供了科学依据。
关键技术方法
研究团队从中国鸡场采集临床样本,通过选择性培养基分离沙门氏菌,采用Illumina平台进行全基因组测序,结合抗生素敏感性试验筛选耐药菌株。通过多位点序列分型(MLST)确定菌株ST型,利用质粒分析工具(如PlasmidFinder)和耐药基因数据库(CARD)注释基因组特征,采用BLAST和系统发育树分析全球菌株的亲缘关系,并通过pan-genome(泛基因组)分析揭示基因库动态。
研究结果
Salmonella isolation and whole-genome sequencing
从2300份样本中分离出5株ST413型S. Mbandaka,其中YK35对6类抗生素耐药,且携带blaOXA-10
,为中国首次报道。
Antibiotic resistance and genomic characteristics
YK35的IncHI2A/IncHI2质粒含12个耐药基因,与国外菌株质粒相似度达99%,提示国际传播。
Discussion
pan-genome分析显示S. Mbandaka具有开放型基因组结构,其辅助基因(如DNA修复相关基因)持续扩张,增强环境适应力。
Conclusion
研究强调需加强国际食品贸易链中S. Mbandaka的监测,尤其关注IncHI2A/IncHI2质粒介导的耐药性扩散。
重要意义
该研究首次揭示blaOXA-10
在中国禽源S. Mbandaka中的出现,证实耐药质粒可通过水平基因转移(Horizontal Gene Transfer, HGT)跨物种传播。全球传播路线的重建为追溯疫情源头提供了分子证据,而开放型pan-genome的发现则解释了该菌株快速进化的遗传基础。这些发现对制定针对耐药性沙门氏菌的“One Health”防控策略具有重要指导价值。
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