黎巴嫩牛源粪便中抗生素耐药性的基因组监测：ESBL及mcr-1.1质粒介导的耐药性传播风险

本研究针对黎巴嫩畜牧业中抗生素滥用导致的耐药性(AMR)危机，通过采集24个农场的牛粪便样本，分离62株ESBL(超广谱β-内酰胺酶)产生菌，结合全基因组测序(WGS)和药敏试验，首次发现携带mcr-1.1基因的IncHI2A/IncFIC多复制子质粒介导的黏菌素耐药株，揭示CTX-M-15和TEM-1B为β-内酰胺类耐药主要基因型，为"One Health"防控策略提供关键数据支撑。

　　

抗生素耐药性(AMR)已成为全球公共卫生的"隐形 pandemic"。在黎巴嫩，畜牧业抗生素滥用与监管缺失形成恶性循环，尤其β-内酰胺类和黏菌素这类"最后防线"抗生素的耐药基因在动物-环境-人之间的传播链尚未明晰。此前研究多聚焦临床和人源菌株，而作为重要耐药基因库的牲畜粪便却长期缺乏系统性监测。黎巴嫩美国大学团队在《Veterinary Microbiology》发表的这项研究，首次绘制了该国牛源耐药菌的基因组流行病学图谱。

研究人员采用跨农场采样策略，从24个奶牛场的35份粪便样本中分离62株ESBL产生菌。通过CHROMagar ESBL选择性培养、药敏试验(disk diffusion assay)结合全基因组测序(WGS)，整合生物信息学分析(in silico
typing)解析耐药基因谱。特别关注了质粒介导的黏菌素耐药机制，采用PCR验证和复制子分型追踪mcr基因传播载体。

E. coli
: the most prevalent recovered organism
37株大肠杆菌(E. coli)占分离菌的59.7%，其中18株属于高耐药风险的B1系统发育群。所有菌株均携带bla_CTX-M-15
和bla_TEM-1B
基因，对阿莫西林、头孢曲松和头孢噻肟100%耐药。值得注意的是ESBL34菌株检测到mcr-1.1基因，该基因位于IncHI2A/IncFIC杂合质粒上，这种多复制子结构可能增强其在菌种间的水平转移能力。

Discussion
研究揭示了黎巴嫩奶牛场存在CTX-M-15主导的ESBL流行现象，与当地医院耐药谱高度相似，暗示动物-人传播链。发现产肠毒素的致病性大肠杆菌株，其同时携带bla_CTX-M-27
和mcr-1.1基因，构成"超级耐药-致病"双重威胁。质粒分析显示IncFIB和IncFII为优势复制子类型，这类接合性质粒可加速耐药基因在肠杆菌科中的扩散。

该研究首次证实黎巴嫩牛源菌株中存在mcr-1.1基因，其搭载的杂合质粒结构比此前禽源报道的IncX4型更具基因重组潜力。作者强调，在缺乏兽医用药监管的背景下，奶牛场可能成为CTX-M和mcr基因的"进化熔炉"。研究为实施基于"One Health"的AMR防控提供了关键分子流行病学证据，建议将牲畜耐药性监测纳入国家公共卫生体系，并严格限制黏菌素在畜牧业的非治疗性使用。