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亚洲璃眼蜱线粒体全基因组解析:揭示蜱类系统发育与分子进化的新视角
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年06月19日 来源:Parasitology Research 1.8
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(编辑推荐)本研究首次完成中国株亚洲璃眼蜱(Hyalomma anatolicum)14,714 bp线粒体全基因组测序,揭示其A+T偏好性(80.04%)及atp8基因的正选择特征,通过13个蛋白编码基因(PCGs)系统发育分析确立其与Hy. excavatum的姐妹群关系,并提出cox3、cytb等9个基因可作为蜱类系统学研究的低成本分子标记,为蜱媒病防控提供重要基因组资源。
亚洲璃眼蜱线粒体全基因组研究突破
Abstract
蜱类作为专性吸血外寄生虫,是多种人畜共患病原体的传播媒介。中国农业科学院兰州兽医研究所团队首次完成亚洲璃眼蜱(Hyalomma anatolicum)中国分离株14,714 bp环形线粒体全基因组测序,该基因组包含13个蛋白编码基因(PCGs)、22个转运RNA(tRNA)和2个核糖体RNA(rRNA),A+T含量高达80.04%,显著高于G+C含量(19.96%)。
Introduction
亚洲璃眼蜱作为克里米亚-刚果出血热病毒(CCHF)等病原体的主要传播媒介,其杀虫剂抗性日益严重。线粒体基因组因其母系遗传、进化速率快等特性,成为研究蜱类系统发育的理想分子标记。
Materials and methods
实验采用Illumina HiSeq 2000平台对实验室保藏虫株进行测序,通过NECAT和NextDenovo组装,MITOS在线工具注释基因。选择压力分析采用KaKs calculator计算13个PCGs的非同义(Ka)与同义(Ks)替换率。
Results
基因组特征
线粒体基因组呈现典型AT偏好性(AT-skew=-0.0295),23个基因位于多数链(J-strand)。最长重叠区59bp(cox3-trnG),最长间隔区51bp(nad1-trnL2)。
选择压力
atp8基因呈现显著正选择(Ka/Ks>1),而cox1基因显示强烈纯化选择(Ka/Ks=0.064)。9个PCGs(cox3、cytb等)被验证可替代全基因组进行系统发育分析。
系统发育
基于13个PCGs构建的最大似然树显示,亚洲璃眼蜱与Hy. excavatum构成姐妹群,分歧时间为1.95百万年前(Mya),是璃眼蜱属最晚分化的物种。
Discussion
该研究填补了亚洲璃眼蜱线粒体基因组空白,提出的简化标记组合将大幅降低蜱类分子鉴定成本。线粒体基因组的高变区(如atp8)与保守区(如cox1)为蜱类进化研究和抗药性靶点开发提供了新方向。
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