意大利北部猪源霍乱沙门氏菌的抗生素耐药性研究：表型与基因型关联分析

本研究针对欧盟地区重新流行的猪源霍乱沙门氏菌（S. choleraesuis ）耐药性数据匮乏问题，通过MIC（最小抑菌浓度）法和全基因组测序（WGS）对188株临床分离株进行分析，发现高耐药率（如磺胺异噁唑90.2%、氨苄西林85.0%）及MDR（多重耐药）菌株携带blaTEM-1B 、tet (A)等基因，为临床用药和耐药监测提供关键依据。

　　

在养猪业中，霍乱沙门氏菌（Salmonella enterica
serovar Choleraesuis, S. choleraesuis
）是一种臭名昭著的病原体，它不仅导致猪群高死亡率、肺炎等系统性感染，还能跨物种感染人类引发败血症。近年来，欧盟多国报告该菌在猪场中重新抬头，但关于其抗生素耐药性（Antimicrobial Resistance, AMR）的数据却寥寥无几。更令人担忧的是，抗生素滥用加剧了耐药性蔓延，而氟喹诺酮类等"关键人类用药"的耐药可能直接威胁公共卫生安全。

为填补这一空白，意大利伦巴第和艾米利亚-罗马涅动物预防研究所的研究团队对2022-2024年间从意大利北部病猪分离的188株S. choleraesuis
展开系统研究。通过表型药敏试验（MIC法）和全基因组测序（WGS）技术，他们不仅揭示了惊人的耐药率——如磺胺异噁唑（90.2%）、恩诺沙星（83.5%）等一线药物普遍失效，还首次在59株MDR菌株中发现bla_TEM-1B

（β-内酰胺酶基因）与floR
（氟苯尼考耐药基因）等关键遗传标记。值得注意的是，对阿莫西林-克拉维酸的敏感性（仅3.2%耐药）为临床治疗提供了新选择。这项发表于《Research in Veterinary Science》的研究，为制定"抗生素分级使用"政策提供了科学依据，同时警示需加强耐药基因跨物种传播监测。

关键技术方法
研究采用CLSI标准化的MIC法检测188株菌对14类抗生素的敏感性；从中筛选59株MDR菌进行Illumina平台全基因组测序，通过ResFinder数据库比对耐药基因；最后通过表型-基因型一致性分析（如Kappa检验）评估预测准确性。样本来源为意大利北部诊断实验室2022-2024年收治的临床病猪分离株。

研究结果

1. 表型耐药特征
MIC结果显示，磺胺异噁唑耐药率最高（90.2%），其次为氨苄西林（85.0%）和恩诺沙星（83.5%）。氟苯尼考（73.9%）、四环素（71.3%）等兽医常用药同样严重失效。令人意外的是，阿莫西林-克拉维酸仍保持96.8%敏感率，提示其作为替代治疗的潜力。

2. 基因型耐药图谱
WGS在MDR菌株中检出高频耐药基因：bla_TEM-1B

（氨苄西林耐药，85%）、tet
(A)（四环素耐药，72%）、floR
（氟苯尼考耐药，68%）及sul2
（磺胺类耐药，62%）。值得注意的是，虽然表型显示59.1%菌株对甲氧苄啶-磺胺甲噁唑耐药，但仅31%携带dfrA
基因，揭示可能存在未知耐药机制。

3. 表型-基因型关联
氨苄西林、氟苯尼考等药物的基因型预测与MIC结果高度一致（Kappa>0.8），而黏菌素（Kappa=0.2）和甲氧苄啶-磺胺甲噁唑（Kappa=0.4）的预测可靠性较低，凸显WGS在部分药物耐药预测中的局限性。

结论与意义
该研究首次系统描绘了意大利猪源S. choleraesuis
的耐药全景图：一方面，MDR菌株携带bla_TEM-1B

等可水平转移的耐药基因，可能通过食物链威胁人类健康；另一方面，阿莫西林-克拉维酸的高敏感性支持其作为二线治疗选择。作者Giorgia De Lorenzi等强调，需建立"表型+基因型"联合监测体系，尤其关注氟喹诺酮类耐药基因的传播动态。这项研究不仅为欧盟抗生素管理指南（如Bassi等2025年方案）提供数据支撑，更警示在"同一健康"框架下协调人兽用药政策的紧迫性。