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基于神经算子变换器的稀疏数据脑血管动力学重建:一种面向数字孪生的快速计算框架
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年06月19日 来源:Computers in Biology and Medicine 7.0
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为解决心血管疾病诊疗中脑血流动力学实时监测的难题,研究人员开发了整合GNOT(通用神经算子变换器)和VANO(变分自编码神经算子)的计算框架,通过1D降阶模型生成合成数据训练网络,实现了从稀疏临床数据中高精度重建Willis环血流动力学参数(平均相对误差<1%),并创新性地采用自适应网格搜索算法推断患者特异性边界条件,为脑血管数字孪生提供了高效解决方案。
脑血管疾病作为全球致残致死的主要原因之一,其诊疗面临重大挑战。传统影像学技术如经颅多普勒超声(TCD)和相位对比磁共振成像(PC-MRI)存在操作依赖性强、耗时长等局限,而计算流体力学模型又受制于高昂的计算成本。特别是在Willis环(CoW)这种复杂血管网络中,如何从有限的临床测量数据重建全脑血流动力学参数,并快速获取患者特异性边界条件(BCs),成为制约数字孪生技术临床应用的关键瓶颈。
针对这一难题,来自波兰波兹南超级计算与网络中心的研究团队在《Computers in Biology and Medicine》发表创新性研究,提出融合神经算子与生成模型的混合计算框架。该工作通过17,129例有限元仿真构建训练数据集,开发了基于通用神经算子变换器(GNOT)的代理模型实现秒级血流预测,结合变分自编码神经算子(VANO)实现输入函数的低维表征,最终通过多阶段优化策略从BA(基底动脉)和ICAs(颈内动脉)的稀疏速度测量中,成功重建全脑血流动力学参数(全局误差3.3%),并创新性地采用自适应网格搜索算法推断Windkessel模型参数,为个性化脑血管数字孪生提供了高效解决方案。
研究采用四项关键技术:1)基于SimVascular的1D降阶模型(ROM)生成17,129例CoW血流动力学仿真数据;2)开发具有几何门控机制的GNOT架构,实现50×100网格上速度/面积/压力的同步预测;3)构建16维潜空间的VANO模型约束输入函数采样;4)设计包含质量守恒/压力连续性的复合损失函数,通过多起点优化求解逆问题。
2.1 1D ROM建模与数据集构建
通过有限元求解器模拟包含33条动脉的CoW网络,采用Olufsen非线性材料模型描述血管壁特性,使用三元素Windkessel模型处理终端边界条件。数据集涵盖HR(60-80bpm)、Q?
(362-543ml/s)等参数的生理变异范围,经10个心动周期仿真后筛选出14,256例有效数据,为后续训练提供多样化样本。
2.2 代理模型性能验证
GNOT在测试集上展现出卓越的预测精度:MCA(大脑中动脉)速度预测误差仅0.53%,ACA A2(大脑前动脉A2段)面积重建误差0.11%。特别值得注意的是,模型在降采样至25×50网格时仍保持稳定性能,且单次前向传播耗时仅0.13秒,较传统FEM求解器加速450倍。
2.3 生成模型评估
VANO成功学习到各动脉特征性流速波形,生成的PSV(峰值收缩速度)、EDV(舒张末期速度)等参数与真实分布无显著差异(PI指数误差<5%)。这种基于潜空间(16维)的约束采样机制,为逆问题求解提供了生理合理的初始猜测。
2.4 逆问题求解结果
在171例验证案例中,框架仅需BA和双侧ICAs的流速测量即可重建全网络血流状态,平均相对l2
误差3.32%。即使在SNR≈11dB的强噪声干扰下,ACoA(前交通动脉)的压力重建误差仍能控制在3.47mmHg以内,展现出临床实用潜力。
2.5 边界条件推断
通过拟合GNOT预测的出口流量/压力波形,自适应网格搜索算法能准确反演各终端的R1
/R2
/C参数,为后续患者特异性仿真提供关键输入条件。
这项研究开创性地将神经算子应用于血管网络PDE求解,其重要意义体现在三方面:首先,GNOT+VANO框架突破了传统CFD方法的计算瓶颈,使实时血流动力学监测成为可能;其次,通过将VANO作为逆问题的生成先验,有效约束了解空间的生理合理性;最后,自适应BCs估计算法为数字孪生的临床落地扫清了关键障碍。未来工作可进一步拓展至病理形态建模,为脑卒中、动脉瘤等疾病的精准诊疗提供新范式。
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