玉米根际来源Talaromyces purpureogenus菌株ISA502的端粒到端粒基因组组装及其生态与生物技术意义

来自意大利的研究团队通过混合测序技术（Illumina短读长+ONT长读长）完成了Talaromyces purpureogenus菌株ISA502的染色体级别基因组组装。该30.33 Mb基因组包含8条染色体，BUSCO完整性达99%，解决了现有基因组碎片化问题，为挖掘其抗菌化合物、色素及酶类生物活性代谢物提供了高精度遗传基础。

　　

玉米根际土壤中分离的真菌Talaromyces purpureogenus因其产生抗菌物质、色素和酶类的能力备受关注。研究人员采用创新性混合测序策略——结合Illumina NovaSeq 6000平台（PE150，177×覆盖度）和牛津纳米孔PromethION 48系统（读长N50 21,477 bp，152×覆盖度），成功构建了该菌株ISA502的端粒到端粒基因组。

经过Canu自校正、LoRDEC混合校正和NextDenovo组装，最终获得8条完整染色体（总长30.33 Mb，GC含量44.44%），所有染色体末端均检测到端粒重复序列(CCCTAA)_n
。BUSCO评估显示99%的保守基因完整性，显著优于现有碎片化基因组。

该研究不仅提供了首个染色体级别的T. purpureogenus参考基因组，更通过高精度组装技术（NextPolish三轮抛光+Pilon校正）为解析其次级代谢产物合成通路奠定基础。菌株在MEA培养基上呈现特征性同心圆菌落形态（图1），其基因组中预测的生物合成基因簇将为农业和生物技术应用开辟新途径。