废水处理厂分离的玫瑰色盐球菌Salinicoccus sp. JC660基因组草图测序及其代谢特征解析

来自印度海得拉巴的研究人员针对极端环境微生物资源开发问题，对废水处理厂分离的Salinicoccus sp. JC660菌株进行全基因组测序。该研究采用Illumina Hiseq X Ten平台获得2.68 Mb基因组草图（GC含量48.5%），通过PGAP注释发现2645个编码基因，并鉴定出萜烯合成基因簇及Mg2+ -ATPase转运蛋白等特殊代谢通路，为嗜盐微生物的工业应用提供分子基础。

　　

科研团队从印度海得拉巴工业区废水处理厂（坐标22°98′ N 71°47′ E）分离出一株玫瑰色盐球菌Salinicoccus sp. JC660。这株革兰氏阳性、无鞭毛的球菌拥有2,686,240 bp的基因组（GC含量48.5%），通过Illumina Hiseq X Ten平台产生384万条测序读长，经Trimmomatic质控和SOAPdenovo组装后获得12个contig（N₅₀
值442,168 bp）。

有趣的是，其16S rRNA与Salinicoccus halitifaciens JC90^T
完全匹配。基因组注释揭示2645个编码基因，包括3套核糖体RNA基因和66个tRNA。特别引人注目的是检测到萜烯合成基因簇，以及610个膜转运相关基因——例如参与生物膜形成的Mg²⁺
-转运ATP酶和有机酸捕获转运体。代谢网络分析显示，该菌在氨基酸代谢（246基因）和辅因子合成（131基因）方面具有突出优势。

这项研究不仅扩充了嗜盐微生物基因组数据库，其发现的EcsAB膜蛋白转运系统（参与跨膜物质运输）和特殊次级代谢产物合成能力，为开发耐盐工业菌种提供了分子蓝图。研究获得海得拉巴大学IoE计划和DBT BUILDER项目的资助。