产黄曲霉毒素真菌Aspergillus texensis与A. toxicus全基因组测序及农业防控意义解析

来自美国农业部的研究团队针对产黄曲霉毒素的Aspergillus texensis和A. toxicus展开全基因组测序研究，首次报道A. toxicus基因组并完善A. texensis基因组数据。通过Illumina短读长测序和SPAdes组装技术，获得38 Mb级高质量基因组（BUSCO完整度98.2%），揭示两菌株间89.68%序列同源性，为作物黄曲霉污染防控提供关键分子资源。

　　

在真菌界臭名昭著的产毒高手——德州曲霉(Aspergillus texensis)和剧毒曲霉(A. toxicus)终于被科学家"基因解码"了！这两种隶属于黄曲霉菌组(Aspergillus section Flavi)的微生物，能分泌强致癌物黄曲霉毒素(aflatoxin)，不仅导致农作物减产，更会引发儿童发育迟缓、肝癌甚至死亡。

研究团队采用Illumina NextSeq 550平台，对分离自德州土壤的菌株NRRL66858(A. texensis)和NRRL66898(A. toxicus)进行150bp双端测序，分别获得1.93Gb和1.59Gb数据。通过SPAdes组装和MAKER注释，构建出包含1.79Mb最大支架(scaffold)的38Mb基因组，GC含量约47.5%。

有趣的是，21-mer频谱分析显示典型的双峰分布，Jellyfish检测到峰值覆盖度分别为67x(A. texensis)和56x(A. toxicus)。与近缘物种黄曲霉(A. flavus)和米曲霉(A. oryzae)的基因组比对发现，这些产毒菌株含有12,000余个蛋白编码基因，其中niaD和cmdA基因100%匹配验证了物种身份。

最令人振奋的是，点阵图(dot plot)分析揭示两菌株间存在89.68%序列相似性，且检测到14条含端粒重复序列的支架。这些发现为开发新型真菌检测标记、解析黄曲霉毒素合成通路提供了"分子地图"，有望帮助农民避免每年高达10.6亿美元的经济损失。

美国农业部团队特别指出，该研究利用SCINet超级计算资源完成，所有数据已上传NCBI（登录号JBJXUZ000000000/JBJXUY000000000），堪称农业病原基因组研究的典范之作。