意大利肌萎缩侧索硬化患者NEK1基因变异谱的探索及其临床意义

这篇研究通过深度测序分析了1016例意大利散发性（SALS）和家族性（FALS）肌萎缩侧索硬化（ALS）患者的NEK1基因变异，发现28个罕见变异（包括18个新变异），其中7例患者同时携带其他ALS致病基因突变（如C9orf72、SOD1等），证实了ALS的寡基因（oligogenic）本质。研究按ACMG标准将变异分为致病性（P）、可能致病性（LP）和意义未明（VUS），并指出NEK1变异携带者的发病年龄和生存期无显著差异，但部分患者表现出非典型感觉症状。该成果扩展了NEK1的遗传变异谱，为ALS机制研究提供了新线索。

　　

背景
肌萎缩侧索硬化（ALS）是一种以运动神经元退化为特征的致命性神经退行性疾病，约10%为家族性（FALS），其余为散发性（SALS）。NEK1编码丝氨酸/苏氨酸激酶，参与DNA损伤修复和纤毛形成等过程，其变异与ALS关联性最初通过外显子测序发现，后经大队列研究验证。

方法
研究纳入1016例意大利ALS患者（含107例FALS），采用扩增子深度测序分析NEK1全编码区，覆盖34个外显子及剪接位点。所有患者已预先筛查四大ALS致病基因（C9orf72、SOD1、TARDBP、FUS）。变异分类依据ACMG指南，结合人群数据库（MAF<1%）和预测工具（如MaxEntScan、HSF）。

结果
共鉴定28个NEK1罕见变异（29例患者，2.85%），包括5个插入缺失、2个无义突变、20个错义变异和1个剪接位点变异。64%（18/28）为新变异，其中4个为LoF（如p.Ile633Asnfs*28）。7例患者携带其他ALS基因突变（如C9orf72 HRE、TARDBP p.Gly294Val），凸显寡基因贡献（19.6%）。值得注意的是，23例携带已知风险变异p.Arg261His（VUS），其中3例合并其他突变。

临床特征
LoF变异患者中位发病年龄52.7岁，生存期28.8个月，无典型“垂臂表型”，但2例报告感觉异常（如肢体疼痛）。基因型-表型分析显示，不同变异类型（LoF、错义、p.Arg261His）患者的发病年龄和生存期无统计学差异（Kruskal-Wallis p=0.40，Log-rank p=0.07）。

讨论
NEK1 LoF变异通过单倍剂量不足（haploinsufficiency）机制致病，而错义变异风险较低。研究首次报道同一氨基酸位点（p.Ile633）的两种不同移码突变，且C末端无功能域的p.Ser1036*与C9orf72 HRE共存时可能通过协同作用加剧DNA损伤。与比利时队列相比，意大利患者中p.Arg261His频率（2.3%）更高，但未发现地域性表型差异。

结论
该研究丰富了NEK1变异谱，证实其作为ALS修饰基因的角色，并强调多基因筛查在临床诊断中的重要性。未来需通过iPSC模型等功能实验进一步解析NEK1与其他ALS基因的交互机制。