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帕金森病MPTP模型小鼠中脂噬相关生物标志物的单细胞测序筛选及机制研究
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年06月21日 来源:Molecular Neurobiology 4.6
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本研究针对帕金森病(PD)中脂噬(lipophagy)的具体机制尚不明确的问题,通过单细胞RNA测序(scRNA-seq)分析MPTP模型小鼠脑组织(PD组n=3,对照组n=3),鉴定出241个差异浸润细胞基因(DIC-DEGs)和664个差异表达基因(DEGs),筛选出Ubb、Gapdh、Cox4i1和Hsp90aa1四个关键生物标志物,发现少突胶质细胞和神经元在PD中具有重要作用,为PD治疗提供新理论依据。
脂噬(lipophagy)可能在帕金森病(PD)发病过程中发挥抗氧化和保护作用,但其具体机制鲜有报道。研究人员采用MPTP诱导的PD模型小鼠脑组织(PD组n=3,对照组n=3)进行单细胞RNA测序(scRNA-seq)。经过质量控制(QC)后,细胞被聚类和注释,鉴定出28个细胞簇,涵盖少突胶质细胞(oligodendrocytes)、星形胶质细胞(astrocytes)和神经元(neurons)等7种已知细胞类型。
研究发现,差异浸润细胞(DICs)中的少突胶质细胞和神经元分别被细分为6个和7个亚群。通过分析获得241个DIC相关差异表达基因(DIC-DEGs)和664个差异表达基因(DEGs),最终筛选出179个候选基因。运用CytoNCA的5种算法确定Ubb、Gapdh、Cox4i1和Hsp90aa1为关键生物标志物。值得注意的是,这4个标志物在PD组和对照组的少突胶质细胞和神经元中表达差异显著。
伪时序分析(pseudotime analysis)显示,这些生物标志物在少突胶质细胞和神经元分化末期表达水平升高。此外,细胞互作分析揭示少突胶质细胞与神经元之间的通讯在PD组和对照组中均较为活跃。该研究不仅鉴定出Ubb、Gapdh、Cox4i1和Hsp90aa1等脂噬相关生物标志物,还证实少突胶质细胞和神经元是PD发病过程中的关键细胞类型,为PD治疗策略开发提供了新的理论基础。
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