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哺乳动物细胞单次使用生物反应器的跨尺度整合模型:流体动力学、动力学与过程控制的耦合优化
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年06月21日 来源:Journal of Biotechnology 4.1
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本研究针对生物反应器放大过程中因流体动力学差异导致的细胞生长环境不一致问题,开发了集成CFD(计算流体动力学)、细胞动力学和PID(比例-积分-微分)控制系统的跨尺度数字孪生模型。通过模拟250mL至2000L三尺度14天培养过程,首次实现流体涡流(10-3秒)、控制器响应(102秒)与细胞生长(106秒)三时间尺度的耦合,揭示谷氨酰胺浓度对CHO细胞生长的关键影响,为生物制药工艺放大提供新范式。
在生物制药领域,将实验室规模的细胞培养工艺放大到工业生产规模,犹如试图用游泳池的搅拌棒均匀混合整个西湖的水——看似简单的体积放大,实则暗藏致命陷阱。传统生物反应器放大依赖功率/体积(P/V)准则,却常常遭遇混合时间延长、剪切力剧增和营养梯度形成三大难题。Alavijeh等学者发现,大型反应器中葡萄糖浓度波动会导致蛋白质异常糖基化,而缺氧区域可使细胞活力下降30%以上。更棘手的是,哺乳动物细胞对谷氨酰胺的敏感度如同婴儿对奶粉配方的挑剔,毫摩尔级别的浓度变化就能显著影响抗体产量。
为破解这一"放大魔咒",来自国外的研究团队在《Journal of Biotechnology》发表突破性研究。他们构建的智能数字孪生系统,首次将GPU加速的计算流体动力学(CFD)、实时PID控制器和细胞代谢网络编织成无缝衔接的三维时空模型。这个系统最惊艳之处在于,它能同时捕捉10-3秒级的微气泡破碎、102秒级的氧气反馈调节和106秒级的细胞增殖过程,相当于用同一台摄像机既记录子弹击穿苹果的瞬间,又拍摄苹果树三年的生长历程。
关键技术方法包括:1) 多尺度CFD建模覆盖250mL-2000L三阶放大体系;2) 整合DO/pH/nutrient的PID控制算法;3) CHO细胞代谢网络动力学模型;4) GPU并行计算实现跨时间尺度耦合;5) 基于功率数(Power number)和混合时间的流体力学验证。
【System set-up and process overview】
研究选取实验室(250mL)、中试(1000L)和工业生产(2000L)三级生物反应器,通过追踪溶解氧(DO)、葡萄糖等6种物质浓度场,发现2000L反应器内营养浓度差异可达实验室规模的15倍。特别值得注意的是,当采用传统P/V放大准则时,谷氨酰胺浓度梯度引发的细胞生长差异比葡萄糖敏感度高8.7倍。
【Notional flow behavior and preliminary validation】
流体动力学验证显示,70RPM搅拌下2000L反应器产生0.9的功率数,与文献值0.6-1.4吻合。模型成功预测到靠近搅拌桨区域的剪切速率高达培养液平均值的50倍,这解释了为何该区域细胞存活率会降低22%。通过调节进料速率,研究人员使不同规模反应器的细胞密度曲线差异控制在±5%以内。
【Conclusions】
这项研究建立的"数字孪生"系统,仅用传统方法1/10的时间就完成14天培养过程的跨尺度模拟。最令人振奋的发现是:通过动态调节进料策略,可使2000L反应器的细胞生长曲线与250mL培养瓶保持90%相似度。这为生物制药行业提供了一把"万能缩放尺",使得从实验室到GMP生产的转化周期有望缩短60%。
讨论部分强调,该模型突破性地将GPU计算优势与反应时间尺度自相似算法结合,首次实现工业级生物反应器的"全要素、全过程"模拟。正如研究者Aparajita Dasgupta指出:"传统CFD就像只绘制河流地图,而我们的模型能同时预测鱼群如何在河水中生长游动。"这项技术不仅适用于单抗生产,还可拓展到CAR-T细胞治疗等新兴领域,为生物制药4.0时代奠定数字基石。
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