SARS-CoV-2感染中核糖体蛋白表达谱的差异分析及其在疾病严重程度中的调控作用

本研究通过生物信息学分析与qRT-PCR实验，揭示了SARS-CoV-2感染患者中核糖体蛋白（RPs）的差异表达模式，发现RPL27a、RPL26和RPL14在轻重症患者中显著下调且存在相关性差异，为宿主导向的抗病毒治疗提供了新靶点。

　　

新冠病毒（SARS-CoV-2）引发的COVID-19疫情已造成全球数百万人死亡，其变异株持续挑战现有防控策略。尽管疫苗和抗病毒药物主要针对病毒结构蛋白，但越来越多的证据表明，宿主核糖体蛋白（Ribosomal Proteins, RPs）在病毒复制和免疫逃逸中扮演关键角色。病毒通过劫持宿主翻译机制（如IRES介导的翻译）或调控RPs磷酸化促进自身增殖，而部分RPs也可能通过激活免疫通路抑制病毒。然而，COVID-19患者中RPs的动态表达及其与疾病严重程度的关系尚不明确。

为填补这一空白，来自伊朗Qazvin医科大学的研究团队在《Microbial Pathogenesis》发表论文，结合生物信息学与实验分析，系统研究了SARS-CoV-2轻重症患者中RPs的表达特征。研究人员首先通过GEO数据库筛选SARS和流感数据集中的差异表达基因（DEGs），锁定候选RPs；随后对临床患者样本（重症66.08±13.35岁，轻症37.58岁）进行qRT-PCR验证，并分析其与临床症状的关联。

关键技术方法

1. 生物信息学分析：基于GSE1739和GSE21802数据集鉴定与病毒感染相关的RPs候选基因；
2. qRT-PCR技术：定量检测轻重症患者中RPL27a、RPL26等靶基因表达水平；
3. 临床队列分析：纳入不同严重程度患者（n未明确），统计年龄、SpO₂、基础疾病等指标。

研究结果
1. In silico DEGs分析
通过SARS和流感数据集交叉分析，发现1467个DEGs，其中RPs通路显著富集，提示其在冠状病毒感染中的保守作用。

2. 临床特征与RPs表达
重症患者年龄更大，SpO₂更低（90.38±9.8 vs 95.57±1.91），且糖尿病、高血压比例更高。qRT-PCR显示RPL27a（重症-0.75±2.95 vs 轻症-1.71±1.91）、RPL26（重症0.021±2.12 vs 轻症-1.23±2.06）和RPL14（重症-1.51±1.9 vs 轻症-0.79±1.5）表达显著下调（P<0.05），而RPL23和RPL31无组间差异。

3. 相关性网络
轻症组中RPL26、RPL14与RPL27a显著共表达，重症组则表现为RPL23与RPL31、RPL27a关联，暗示疾病严重程度可能重塑RPs互作网络。

结论与意义
该研究首次证实SARS-CoV-2感染导致特定RPs（如RPL27a、RPL14）的差异表达，且其调控模式与疾病严重程度相关。这些RPs可能通过影响病毒翻译（如IRES依赖机制）或免疫应答（如干扰素通路）参与COVID-19进展。研究为开发靶向宿主RPs的抗病毒策略（如小分子抑制剂或基因调控）提供了理论依据，尤其针对非必需RPs（如RPL3、RPL18）的设计可减少对宿主正常功能的干扰。未来需进一步探索RPs与病毒蛋白的直接互作及其在临床治疗中的转化潜力。