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红海海绵共生真菌的细胞毒性评价与代谢组学分析:基于计算机模拟研究的抗癌潜力探索
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年06月21日 来源:Scientific Reports 3.8
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本研究针对癌症治疗需求,从红海海绵Spheciospongia vagabunda分离出Aspergillus sp.(UR1)和Penicillium sp.(UR2)两种真菌,通过LC-HR-ESI-MS代谢组学分析发现26种活性化合物,其中UR1提取物对HepG2、CaCo-2和MCF7癌细胞系显示出显著细胞毒性(IC50 2.61-3.41 μg/mL),分子对接揭示PPARG基因是主要作用靶点(结合能达-9.13 kcal/mol),为海洋天然产物抗癌药物开发提供新线索。
癌症作为全球公共卫生重大挑战,其治疗面临耐药性和毒性等瓶颈问题。海洋生态系统因其独特的生物多样性,成为新型抗癌化合物的重要来源。其中,海绵共生真菌因其与宿主的协同进化关系,能产生结构新颖的次级代谢产物。来自埃及德雷亚大学等机构的研究团队聚焦红海海绵Spheciospongia vagabunda共生真菌,通过多学科交叉研究,发现其代谢产物对多种癌细胞具有显著抑制作用,相关成果发表于《Scientific Reports》。
研究采用18S rRNA基因测序鉴定真菌种类,LC-HR-ESI-MS技术进行非靶向代谢组学分析,MTT法评估细胞毒性,结合STRING数据库构建蛋白互作网络,并通过AutoDock Vina进行分子对接。实验所用海绵样本采集自红海Ahia Reefs,经埃及国家海洋与渔业研究所鉴定。
Isolation and identification of the marine sponge-associated fungi
通过18S rRNA和ITS序列分析,鉴定出两株真菌分别为Aspergillus sp.(UR1)(与Aspergillus nidulans ATCC 10074相似度99.39%)和Penicillium sp.(UR2)(与Penicillium limosum CBS 339.97相似度99.8%),基因序列已存入GenBank(PP843228-PP843231)。
Metabolomics profiling
采用LC-HR-ESI-MS技术从UR1中鉴定出13种化合物,包括具有抗癌潜力的螺环生物碱teraspiridole A(1)和环四肽aspercolorin(6);从UR2中发现13种代谢物,如二萜类condidogenone H(18)和meroterpenoid arisugacin F(20)。质谱数据通过Mzmine 2.10软件处理,化合物结构经DNP数据库比对确认。
Cytotoxic activity
MTT实验显示UR1提取物对HepG2、CaCo-2和MCF7的IC50分别为2.61±0.12、3.23±0.21和3.41±0.18 μg/mL,显著优于UR2提取物(17.65-22.45 μg/mL)。阳性对照多柔比星IC50为1.32-2.12 μg/mL。
Computational study
网络药理学筛选出20个核心靶点,其中PPARG、EGFR、ESR1和GSK3β位列前茅。分子对接显示化合物6(UR1)与PPARG结合能达-9.13 kcal/mol,通过氢键与Glu295/Glu343相互作用;化合物16(UR2)与PPARG结合能为-8.38 kcal/mol,与Arg288/Ser342形成氢键网络。
该研究首次系统揭示了红海海绵共生真菌的化学多样性与抗癌机制,证实PPARG是其主要作用靶点。特别是环肽类化合物6和生物碱16展现强结合活性,为开发靶向核受体通路的抗癌药物提供先导化合物。未来需进一步开展化合物分离纯化与体内实验,验证其临床转化潜力。研究同时凸显海洋微生物资源在药物发现中的战略价值,为开发低毒性抗癌剂开辟新途径。
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