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基于多重微生物模式识别蛋白与磁珠棘轮技术的快速病原体富集检测新方法
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年06月21日 来源:SLAS Technology 2.5
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针对病原体诊断中样本制备的瓶颈问题,研究人员开发了结合FcMBL、CRP和DC-SIGN三种模式识别蛋白的磁珠捕获系统,通过磁性棘轮技术实现10 mL样本中4-4000 CFU/mL微生物的30分钟内高效富集。该系统可兼容18种细菌和病毒模型,PCR验证显示其适用于多种感染源和样本类型,为广谱病原体诊断提供了新型工具。
在传染病防控和临床诊断中,样本制备环节长期存在效率低下、通量受限的瓶颈问题。COVID-19大流行期间核酸检测试剂短缺的困境,以及血流感染中耐药菌鉴定的延迟(通常需要12小时以上培养),都暴露出传统方法的局限性。现有技术往往受限于特定样本基质(如血液、痰液)或病原体类型(细菌/病毒),而广谱捕获技术如FcMBL(Fc-甘露糖结合凝集素)虽能识别90余种病原体,但对部分菌株(如肺炎克雷伯菌)需机械破碎处理,且缺乏有效的富集手段。
为突破这些限制,来自Ferrologix等机构的研究团队在《SLAS Technology》发表研究,创新性地将多重模式识别蛋白(FcMBL、C反应蛋白CRP和树突状细胞特异性ICAM-3结合非整合素DC-SIGN)与磁性棘轮技术结合,开发出可处理10 mL大体积样本的快速富集系统。该研究通过病原体结合实验、磁珠棘轮分离和qPCR验证三大技术模块,证实了该系统对18种细菌和病毒模型的高效捕获能力,为广谱病原体诊断提供了全新解决方案。
关键技术方法
研究采用1 μm Sera-Mag?磁珠通过EDC化学法偶联三种模式识别蛋白,在钙离子依赖条件下进行病原体标记。磁性棘轮系统采用镍铁合金微柱阵列(5 μm宽/高),通过旋转磁场(5 Hz)驱动磁珠-病原体复合物跨梯度间距(10-50 μm)迁移。样本处理包括缓冲液灌注、样本加载(0.4 mL/min)、磁棘轮分离(30分钟)和分区收集四步。使用SYPRO Ruby染色凝胶电泳和TaqMan探针qPCR(引物针对大肠杆菌和肺炎克雷伯菌16S rRNA)评估捕获效率。
研究结果
1. 多重模式识别磁珠的广谱捕获能力
静态磁捕获实验显示,三种磁珠组合对测试的10种细菌(包括鲍曼不动杆菌、金黄色葡萄球菌等)均实现有效捕获,其中DC-SIGN对芽孢杆菌孢子的捕获率较FcMBL提高20%。病毒模型实验证实其对埃博拉假病毒、登革热VLP等8种病毒颗粒的结合能力。
2. 磁性棘轮系统的性能优化
数值模型预测1 μm磁珠在5 Hz转速下临界间距为34 μm,实验证实该参数可使大肠杆菌复合物有效迁移。10 mL缓冲液样本处理显示,60-75%的捕获病原体能被棘轮至分离区,qPCR检测下限达20 CFU(Cq值39.47)。
3. 全血样本的适应性验证
尽管血液组分导致磁珠-病原体复合物聚集(影响临界间距分布),系统仍可从4-4000 CFU/mL血样中回收病原体。5倍稀释血液样本可提升捕获效率,混合磁珠对贫血患者血液中肺炎克雷伯菌的捕获率较单磁珠提高15%。
4. 下游分析兼容性
ChargeSwitch?纯化后的核酸经qPCR检测,熔解曲线Tm值稳定在85±0.5°C,与直接提取样本无显著差异,证实分离过程未引入抑制剂。
结论与意义
该研究首次将磁性棘轮技术应用于病原体诊断领域,通过整合多重模式识别蛋白,突破了单一捕获配体的局限性。系统在30分钟内完成大体积样本处理的能力,显著优于传统离心或微流控方法(通常需2小时以上)。特别值得注意的是,其对血流感染低载量病原体(<10 CFU/mL)的富集效能,为耐药菌快速鉴定提供了新思路。未来通过集成微流控PCR腔室,有望实现“样本进-结果出”的全封闭检测,这对突发传染病响应和偏远地区诊断具有重要价值。
局限性在于当前血液处理需预稀释,且对某些革兰阴性菌(如阴沟肠杆菌)捕获效率仍需优化。作者建议后续开展临床样本与金标准方法的头对头比较,并探索更多病原体类型的适用性。这项技术为开发通用型样本制备平台奠定了重要基础,其模块化设计也支持根据疫情需求快速调整捕获配体组合。
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