多模态人工智能联合分析生理波形提升心血管性状遗传预测效能

【字体: 时间:2025年06月21日 来源:AJHG 9.8

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  本文推荐:研究者开发了多模态AI模型M-REGLE,通过联合分析心电图(ECG)和光电容积图(PPG)等互补生理波形,显著提升心血管性状的遗传发现能力。相比单模态分析,该方法多检出19.3%的遗传位点,并改善房颤(Afib)等疾病的样本外预测。研究证实多模态学习能更高效捕捉器官系统的互补信息,为可穿戴设备数据利用提供新范式。

  

多模态AI解锁心血管遗传密码

健康数据天然具有多模态特性。来自Google Health的研究团队创新性开发了M-REGLE框架,通过深度学习模型联合解析心电图(ECG)和光电容积图(PPG)等生理波形,在心血管遗传研究领域取得突破性进展。这项发表在顶级期刊的研究,揭示了多模态学习如何突破传统单模态分析的局限。

方法学革新:从单模态到联合表征

研究团队构建的M-REGLE模型基于变分自编码器(VAE)架构,采用早期融合策略将12导联ECG或ECG+PPG波形联合编码为低维嵌入。关键技术突破在于:

  1. 通过卷积神经网络提取波形时空特征
  2. 引入KL散度约束确保潜变量解耦
  3. 主成分分析(PCA)正交化处理
    与传统单模态REGLE(U-REGLE)相比,M-REGLE在12导联ECG重建误差降低72.5%,ECG+PPG组合误差降低20.23%。典型相关分析(CCA)显示导联间相关性从0.62(III-V2)到0.98(V5-V6)不等,证实存在互补信息。

解码心脏的遗传蓝图

在UK Biobank 4.8万样本中,M-REGLE展现出卓越的遗传发现能力:

  • 12导联ECG分析:多检出23个基因位点(+19.3%),预期χ2统计量提升22%
  • ECG+PPG组合:新增7个位点(+13%),χ2统计量增加16.4%
    特别值得注意的是,第四潜变量对应QT间期延长和PPG切迹消失,第十潜变量反映ECG振幅降低,这些特征与房颤表型高度相关。GWAS Catalog验证显示,85.9%的发现位点与已知心血管位点重叠,9个新位点在Open Targets数据库中获得独立验证。

从基因到临床:风险预测的飞跃

多基因风险评分(PRS)验证是研究的另一亮点。在UK Biobank测试集中:

  • 房颤预测AUROC从0.57提升至0.59
  • 顶部5%高风险人群的疾病发生率显著提高
    这一优势在印第安纳生物银行、EPIC-Norfolk和英国女性心脏健康研究(BWHHS)三个独立队列中得到验证。尤其对于PPG脉搏率、收缩压(SBP)等表型,M-REGLE衍生PRS均显示显著优势。

智能穿戴时代的遗传学研究范式

研究特别探讨了智能手表采集的I导联ECG+PPG数据价值。通过模拟验证,当模态间存在互补信息时(相关系数0.43),联合建模能更高效利用有限潜变量:

  1. 共享信息被整合到少量维度
  2. 剩余容量用于捕捉模态特异性信号
    这种特性使M-REGLE特别适合处理可穿戴设备产生的高通量生理数据。

局限与展望

研究者坦承当前仅分析了欧洲裔人群,且使用中值心跳波形可能丢失部分信息。未来方向包括:

  • 扩展至多族群分析
  • 开发处理缺失数据的算法
  • 探索更多模态组合(如加入肺活量图)
    开源代码已发布,为领域发展奠定基础。

这项研究标志着心血管遗传学进入多模态时代。通过AI驱动的联合表征学习,研究者不仅揭示了新的遗传机制,更为个性化医疗和可穿戴设备应用开辟了新途径。随着生物医学数据持续增长,M-REGLE框架有望成为解析复杂性状遗传架构的标准工具。

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