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人工智能驱动的新型TLR7选择性拮抗剂支架发现及其在增强mRNA翻译效率中的应用
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年06月21日 来源:European Journal of Pharmaceutical Sciences 4.3
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推荐:本研究针对TLR7拮抗剂开发不足和选择性差的难题,利用AI工具MotifGen筛选出新型吡啶/喹啉类TLR7拮抗剂。通过虚拟筛选和分子对接获得两个高选择性化合物(IC50 36.8-95.7 μM),证实其可显著增强mRNA转染效率(体内提升1.6倍),为自身免疫疾病治疗和mRNA疗法优化提供新策略。
在免疫治疗领域,Toll样受体7(TLR7)犹如一把"双刃剑"——它既能识别病毒RNA启动抗病毒反应,过度激活却会导致系统性红斑狼疮(SLE)等自身免疫疾病。尽管TLR7激动剂研发如火如荼,但拮抗剂开发却严重滞后,现有化合物普遍存在选择性差(难以区分TLR7/8/9)和结构单一等问题。更棘手的是,在mRNA疗法蓬勃发展的今天,TLR7对未修饰mRNA的识别会触发干扰素风暴,严重制约治疗效果。这些瓶颈呼唤着创新解决方案。
为突破这些限制,来自韩国科学技术研究院(KIST)的研究团队在《European Journal of Pharmaceutical Sciences》发表了一项跨界研究。他们巧妙融合人工智能(AI)与实验验证,开发出具有全新骨架的高选择性TLR7拮抗剂,并开创性地将其应用于增强mRNA治疗效率。这项研究不仅为自身免疫疾病带来新希望,更为mRNA疗法提供了"去免疫原性"的新思路。
研究团队采用三大关键技术:1)基于MotifGen AI模型的虚拟筛选系统,以0.01秒/分子的速度分析760万化合物库;2)Rosetta GALigandDock柔性对接技术评估结合能;3)双报告基因系统(Quanti-Blue检测TLR抑制,荧光素酶评估mRNA翻译)进行功能验证。动物实验采用C57BL/6小鼠模型评估体内效果。
在AI辅助的TLR7拮抗剂探索中,研究团队首先通过MotifGen的"结合概率预测-结构相似性过滤-分子对接"三级筛选流程,从ZINC20化合物库中锁定50个候选分子。其中化合物D(8-甲氧基喹啉衍生物)和F(嘧啶乙酰胺衍生物)凭借独特骨架脱颖而出。体外实验显示,二者对TLR7的IC50分别为95.7 μM和36.8 μM,且对TLR8/9的选择性比高达2倍,显著优于现有双拮抗剂(如临床阶段的afimetoran)。分子对接揭示其选择性源于SER530氢键——该残基在TLR8/9中突变为丙氨酸,导致结合能升高。
令人振奋的是,在mRNA转染增效研究中,化合物F展现出双重价值。在HEK293细胞中,即使9.2 μM(1/4 IC50)的F也能使野生型(WT)mRNA的荧光素酶表达提升3倍。更关键的动物实验证实,F与WT mRNA共处理可使小鼠发光信号增强1.6倍,效果媲美5-甲氧尿苷修饰(moU)mRNA,但规避了修饰核苷潜在的安全隐患。机制研究表明,F通过阻断TLR7对mRNA的识别,有效抑制了IFN-α等干扰素的产生,为mRNA疗法提供了"天然骨架+免疫抑制"的创新组合策略。
这项研究开创了多个"首次":首次将AI驱动的MotifGen应用于TLR拮抗剂发现,首次报道吡啶/嘧啶类TLR7选择性拮抗剂,更是首个证实TLR7拮抗剂可增强非修饰mRNA疗效的研究。从转化医学角度看,化合物F的分子量(约350 Da)和logP值(<3.5)符合Lipinski规则,具备良好成药性。研究者特别指出,该策略可延伸至自身免疫疾病治疗——既能直接抑制TLR7通路缓解症状,又能提升治疗性mRNA的表达效率,实现"一箭双雕"。
当然,该研究也存在优化空间。如拮抗剂效力较临床候选药物仍有差距,未来可通过基于结构的优化(如DeepFrag AI建议的片段替换)提升活性。值得关注的是,补充材料中展示的优化分子已显示结合能降低50%的潜力。随着后续在狼疮模型中的验证,这类AI设计的"智能拮抗剂"或将开启精准免疫治疗的新纪元。
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