医院获得性感染溯源：12株甘露醇罗尔斯顿菌(Ralstonia mannitolilytica)临床分离株与污染化妆水喷雾的基因组关联分析

来自瑞士洛桑大学医院的研究人员通过基因组测序技术，揭示了3例住院患者感染的甘露醇罗尔斯顿菌(R. mannitolilytica)与医院化妆水喷雾污染源的直接关联。研究对12株分离株（3例患者+9株环境样本）进行全基因组测序(WGS)，发现SNP差异<10个，证实了含OXA-443/444 β-内酰胺酶的菌株克隆传播，为医院感染防控提供了分子流行病学证据。

　　

这项研究揭示了医院环境中潜伏的水源性致病菌威胁。科研团队从瑞士洛桑大学医院(坐标46.524866934584246, 6.642684751705649)的3名患者和9份化妆水喷雾中分离出甘露醇罗尔斯顿菌(Ralstonia mannitolilytica)，这种携带OXA-443/444 β-内酰胺酶的"水刺客"能引发机会性感染。

通过Illumina MiSeq平台生成151-251bp双端测序读长，采用SPAdes 3.15.4进行基因组组装，所有菌株的基因组大小约4.96Mb，GC含量稳定在65.75%。CheckM评估显示组装完整性高达99.94%，污染率仅1.07%。

关键发现令人震惊：患者分离株与喷雾分离株的SNP差异≤7个，其中6株完全一致（0 SNP），就像细菌的"分子指纹"完美匹配。这些携带OXA型耐药基因的菌株，通过喷雾装置上演了真实的"医院惊魂"。

研究团队建立的Snakemake分析流程（GitHub可查）像精密侦探，用bwa mem比对和GATK HaplotypeCaller捕捉SNP线索，最终锁定污染源——那些看似无害的保湿喷雾，实则是致病菌的"特洛伊木马"。