玉米根际 Priestia megaterium CIMT4 菌株全基因组测序及其植物促生机制解析

【字体: 时间:2025年06月21日 来源:Microbiology Resource Announcements 0.7

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  来自韩国庆北国立大学的研究人员对玉米根际分离的 Priestia megaterium CIMT4 菌株进行全基因组测序,揭示了其作为植物根际促生菌(PGPR)的基因组特征。该菌株基因组大小为5.7-Mb,GC含量37.9%,包含5,705个蛋白编码基因和7个质粒,为开发环境友好型生物肥料和生物防治剂提供了重要资源。

  

科学家们成功解析了从玉米(Zea mays)根际土壤中分离的 Priestia megaterium (原 Bacillus megaterium)CIMT4菌株的完整基因组序列。这个革兰氏阳性杆状菌被重新归类为Priestia属,不仅具有生物防治和促进植物生长的双重功能,还能通过合成聚羟基丁酸酯(PHB)促进环境可持续发展。

研究团队在刚果民主共和国(南纬2°20′08″,东经28°46′59″)海拔1,734米的玉米田中采集样本,通过系列纯化培养和牛津纳米孔(ONT)MinION平台测序,获得N50为7,181bp的172,623条读长。使用Flye软件组装出5,728,665bp的基因组,包含1条染色体和7个质粒,注释到5,967个基因。

与参考菌株NBRC 15308的比较基因组分析显示98.4%的平均核苷酸一致性(ANI),CheckM评估显示基因组完整度达96.22%。该菌株特有的环境适应基因簇和代谢通路,为其在减少化肥农药使用、污染物降解等农业可持续发展领域的应用提供了分子基础。

特别值得注意的是,该菌株基因组中鉴定到多个与植物激素合成、铁载体产生相关的基因簇,这可能是其作为植物根际促生菌(PGPR)的关键分子机制。韩国农村发展厅和教育部资助的这项研究,为开发新一代农业微生物制剂奠定了重要基础。

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