生物膜-食草动物系统中抗生素耐药性动态的实验评估:环境与肠道微生物组的互作机制

【字体: 时间:2025年06月22日 来源:Environmental Pollution 7.6

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  本研究针对环境生物膜作为抗生素耐药基因(ARG)传播热点的问题,通过构建非洲爪蟾(Xenopus laevis)幼虫-河流生物膜模型系统,揭示了不同污染源生物膜对肠道菌群耐药组的差异化影响。研究发现下游污水处理厂附近的Biofilm B显著增加aac3-IVa基因丰度,证实了环境-宿主双向细菌迁移在AMR传播中的关键作用,为"One Health"策略提供了实验依据。

  

抗生素耐药性(AMR)已成为21世纪全球健康的最大威胁之一,每年导致全球约70万人死亡。尽管医疗系统是AMR防控的重点,但越来越多的证据表明,环境中的生物膜、土壤和水体正在成为耐药基因(ARG)的"孵化器"。特别令人担忧的是,这些环境耐药基因可能通过水平基因转移(HGT)进入病原菌,而水生生物通过摄食生物膜可能成为传播媒介。然而,环境与宿主之间复杂的微生物互作如何影响AMR传播,至今仍是未解之谜。

法国科研团队在《Environmental Pollution》发表的研究中,创新性地构建了"生物膜-食草动物"模型系统。他们采集法国奥克西塔尼大区两条不同污染特征的河流生物膜(Biofilm A来自图卢兹上游相对清洁河段,Biofilm B来自污水处理厂下游),以非洲爪蟾(Xenopus laevis)幼虫为模式生物,通过12天的对照实验,结合16S rRNA测序和高通量qPCR(定量PCR)技术,系统分析了肠道菌群与生物膜间ARG的迁移规律。

【Biofilm collection】
研究选取的两种生物膜具有显著差异:Biofilm B来自污水处理厂下游,其初始细菌载量(4.5×1011 copies/unit)是上游Biofilm A(5.2×1010 copies/unit)的8.7倍,且富含临床相关耐药基因aac3-IVa。

【Microbiota and resistome characteristics prior grazer addition】
实验前分析显示,两生物膜均以变形菌门(Proteobacteria)为主(60.1-74.2%),但Biofilm B的Rhodobacteraceae科丰度显著更高——该菌科被怀疑是多重耐药基因的潜在宿主。

【关键发现】

  1. 生物膜摄食显著改变肠道耐药组:与商业饲料组相比,摄食两种生物膜的爪蟾肠道总ARG丰度下降,但Biofilm B组出现aac3-IVa特异性富集。
  2. 细菌迁移呈现方向性:Procrustes分析证实,肠道菌群向生物膜的迁移量是反向迁移的2.3倍,但Biofilm B向肠道的迁移率比Biofilm A高68%。
  3. 环境压力驱动耐药传播:污水处理厂下游的Biofilm B表现出更强的ARG"外溢"能力,其携带的aac(6')-Ib-cr等基因通过Rhodobacter等菌属向宿主转移。

这项研究首次量化了环境生物膜与宿主间的ARG双向流动,揭示出三个重要规律:① 生物膜不仅是ARG储存库,更是活跃的传播媒介;② 污染压力改变生物膜的"基因溢出"潜力;③ Rhodobacter等共生菌可能在跨环境耐药传播中起桥梁作用。这些发现为制定基于生态系统的AMR防控策略提供了科学依据,特别提示污水处理厂下游水域需要加强生物膜监测。正如作者强调的,理解环境-宿主界面的微生物对话,将是实现"One Health"目标的关键突破点。

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