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靶向PcORP1 PH结构域的新型抑制剂发现:虚拟筛选、结构优化与抗卵菌机制研究
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年06月22日 来源:European Journal of Medicinal Chemistry 6.0
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本研究针对卵菌病害防治难题,通过虚拟筛选和结构优化策略,发现靶向PcORP1蛋白PH结构域的高效抑制剂X4。该化合物对6种卵菌EC50值达1-4 μg/mL,通过干扰脂质转运抑制菌丝生长,叶片实验显示200 μg/mL浓度下防效超90%,为卵菌靶向药物开发提供新思路。
卵菌病害是威胁全球农作物安全的重大难题,其中疫霉菌(Phytophthora)引发的晚疫病等病害具有爆发性强、防治难度大的特点。传统杀菌剂面临抗药性加剧和生态环境压力,而现有靶向ORP1蛋白ORD结构域的OSBPI类杀菌剂虽高效却存在作用靶点单一的问题。中国农业科学院植物保护研究所的研究团队另辟蹊径,将目光投向ORP1蛋白中尚未被充分开发的PH结构域(Pleckstrin homology domain,磷脂酰肌醇结合域),通过多学科交叉策略成功发现新型抑制剂X4,相关成果发表于《European Journal of Medicinal Chemistry》。
研究采用虚拟筛选结合实验验证的技术路线:首先基于PcORP1-PH结构域晶体结构(未发表数据)建立药效团模型;其次通过分子对接从ChemDiv数据库筛选15个候选分子;最终经Lipinski五规则和结构优化获得先导化合物VS-07及其27个衍生物。关键技术包括MOE 2020.09软件分子对接、离体叶片保护实验、EC50测定等。
【Identification of a hit compound through docking-based virtual screening】
以O-磷酸-L-丝氨酸(OPS)为模板建立药效团模型,发现先导化合物VS-07与PcORP1-PH结构域的Trp51、Ser91等关键氨基酸形成氢键网络,其抑制活性为后续结构优化奠定基础。
【Structural optimization and biological evaluation】
通过修饰VS-07的三大结构模块,获得活性提升的化合物X4。该化合物对辣椒疫霉(P. capsici)等6种卵菌表现出广谱抑制性,EC50值较先导化合物提升3-5倍,且能诱导菌丝异常增生和细胞膜皱褶。
【Molecular docking】
分子对接揭示X4与PH结构域结合模式发生显著变化:除保留与Trp51、Thr93的氢键外,新增与Ser91的氢键相互作用,结合自由能计算证实其亲和力提升。
【Preliminary mechanistic studies】
机制研究表明X4通过靶向PH结构域干扰ORP1介导的脂质转运功能,导致病原体膜结构异常。离体叶片实验证实200 μg/mL浓度下对辣椒疫霉防效达92.3%,显著优于对照药剂。
该研究首次证实ORP1-PH结构域可作为卵菌抑制剂的新靶点,突破现有OSBPI类杀菌剂仅靶向ORD结构域的限制。化合物X4的发现不仅为卵菌病害防控提供候选药物,其"多氢键锚定"的设计策略更为蛋白-脂质相互作用界面抑制剂的开发提供范式。研究获得国家重点研发计划(2022YFD1401300)和国家自然科学基金(31730075)支持,由Xili Liu和Xingxing Lu共同主导完成。
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