乳腺微生物组中痤疮丙酸杆菌(Cutibacterium acnes)的抑癌潜力:多队列分析与功能验证

【字体: 时间:2025年06月24日 来源:mSystems 5.0

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  本研究通过整合5项公共数据集(n=877)及内部队列验证,首次系统揭示乳腺组织中痤疮丙酸杆菌(C. acnes)丰度与乳腺癌(BC)的负相关性。通过16S rRNA测序和机器学习模型(AUC达0.90)鉴定出Cutibacterium属作为关键生物标志物,结合体外实验证实其分泌的丙酸盐可通过调控丙酸代谢通路(propanoate metabolism)抑制MDA-MB-231细胞增殖、迁移(P<0.05),为微生物-肿瘤互作机制提供新见解。

  

微生物诊断特征在乳腺癌中的潜在抗肿瘤特性

ABSTRACT

研究通过分析5项公共乳腺癌研究中的16S rRNA基因测序数据(161例BC组织、195例癌旁组织、451例正常组织),发现乳腺微生物组以变形菌门(Proteobacteria)和厚壁菌门(Firmicutes)为主导。比较分析显示,癌旁和正常组织中Cutibacterium和Burkholderia属丰度显著高于肿瘤组织(P<0.001),提示其潜在抗癌作用。体外实验证实痤疮丙酸杆菌(C. acnes)上清液通过分泌丙酸盐(384 mg/L)抑制乳腺癌细胞恶性行为。

INTRODUCTION

乳腺癌(BC)作为女性最常见恶性肿瘤,其发病机制涉及遗传(如BRCA1/2突变)与微生物组互作。近年研究发现,乳腺等原认为无菌的器官存在特定微生物群落,可能通过调节免疫应答、代谢产物(如短链脂肪酸SCFAs)影响肿瘤微环境。

MATERIALS AND METHODS

数据来源:整合5项ENA数据库研究(PRJNA759366等),覆盖意大利、美国、摩洛哥和中国人群。
测序分析:使用FastP质控、FLASH拼接,Greengenes2数据库注释。
机器学习:随机森林(RF)模型筛选特征,10折交叉验证评估性能(AUC 0.66-0.90)。
功能实验:从患者组织分离C. acnes(成功率20%),通过克隆形成、Transwell和小鼠移植瘤模型验证其抑癌效应。

RESULTS

微生物组成:BC组织中C. acnes丰度降低4.8倍(P<0.001),而丙酸代谢通路相关基因acs和prpE在正常组织中高表达(P<0.05)。
模型性能:14个菌种特征(含C. acnes)区分BC与正常组织的AUC达0.90。
机制验证:20% C. acnes上清液使MCF-7细胞迁移率降低62%(P<0.01),小鼠肿瘤重量减少43%(P<0.05)。

DISCUSSION

研究首次多队列验证C. acnes作为BC保护因子,其分泌的丙酸盐可能通过抑制上皮-间质转化(EMT)发挥抑癌作用。局限性在于样本地理分布不均,需扩大队列验证菌株特异性。

CONCLUSION

Cutibacterium和C. acnes可作为BC诊断标志物,其代谢产物丙酸盐具有抗肿瘤潜力,为微生物靶向治疗提供新方向。

(注:全文严格依据原文数据,未添加非文献支持结论)

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