泰国脓毒症患者分离的鸟分枝杆菌复合体基因组测序及新分类单元发现

来自泰国和日本的研究人员针对鸟分枝杆菌复合体(MAC)的临床分离株开展基因组研究，通过Illumina测序和SPAdes组装获得6.3 Mb基因组草图，ANI分析揭示其与已知MAC菌株相似度<95%，代表MAC组内新分类单元，为罕见非结核分枝杆菌感染的分子诊断提供重要参考。

　　

在泰国一名45岁女性脓毒症患者血液中，研究人员分离出一株特殊的分枝杆菌菌株MUNTM1。该菌株在L?wenstein-Jensen(LJ)培养基上培养10天后，采用Illumina MiniSeq平台进行全基因组测序，获得包含192个contig、GC含量67.3%的6.3 Mb基因组草图。

通过CLSI M24标准进行的药敏试验显示，该菌株对阿米卡星(MIC=16 μg/mL)和克拉霉素(2 μg/mL)敏感，但对莫西沙星和利奈唑胺呈中介。SPAdes组装和DFAST注释系统鉴定出5,864个编码序列，基因组完整度达99.86%。

关键发现在于FastANI分析：与鸟分枝杆菌复合体(MAC)成员Mycobacterium vulneris(92.87%)和M. senriense(92.53%)的相似度均低于物种界定阈值95%，表明这是MAC组内一个未被报道的新分类单元。值得注意的是，M. vulneris此前仅从犬咬伤和儿童淋巴结感染中分离，而M. senriense的临床分离记录更为罕见。

该研究首次报道了MAC相关菌株引起血流感染的基因组特征，为理解这类环境分枝杆菌的致病潜力提供了分子证据。测序数据已提交至DDBJ数据库，菌株保藏于日本国立感染症研究所。