中国沈阳溪河沉积物中脱硫弧菌TCA菌株的基因组解析：一种具有1,1,1-三氯乙烷还原脱氯能力的新型硫酸盐还原菌

来自中国的研究团队从沈阳溪河沉积物中分离出一株新型脱硫弧菌TCA，该菌株能高效还原脱氯1,1,1-三氯乙烷（1,1,1-TCA）。通过Illumina+PacBio混合测序获得其3.5 Mb染色体（GC含量66.2%）和3.2 kb质粒（GC含量59.9%），基因组分析揭示了硫酸盐还原通路关键基因（aprA、dsrD等）和氢代谢相关基因（hypA）。该研究为有机氯污染生物修复提供了新的微生物资源。

　　

在中国沈阳的溪河沉积物（北纬41.7922°，东经123.4328°）中，科学家们培养出一株能吃掉有毒化学物质的特殊细菌——脱硫弧菌(Desulfovibrio) TCA菌株。这个小家伙有个了不起的本领：能把顽固的1,1,1-三氯乙烷(1,1,1-TCA)分解成无害物质。

研究团队用"基因组侦探工具箱"揭开了它的生命密码：
• 3.5兆碱基的环形染色体（像扭结的橡皮圈）藏着3,296个基因
• 59.9% GC含量的迷你质粒（3.2 kb）可能是它的"技能扩展包"
• 装备了全套硫酸盐还原"分子机器"：腺苷酰硫酸激酶(ACEB74_03910)、aprA基因(ACEB74_14555)
• 还有氢代谢"充电宝"——氢化酶成熟蛋白(ACEB74_01155)和镍伴侣蛋白hypA

最有趣的是，虽然和它的表亲Desulfovibrio aminophilus有98.6%的16S rRNA相似度，但TCA菌株多了降解有毒化合物的隐藏技能。科学家们用Illumina短读长（5.8百万条reads，Q30>93%）和PacBio长读长（N50达49,582 bp）的"组合拳"破解了它的基因组，就像用高清显微镜和广角镜同时观察DNA拼图。

这些发现不仅为治理有机氯污染提供了新的"微生物清洁工"，还揭示了硫酸盐还原菌在元素循环中的奇妙适应性。该研究获得中国国家自然科学基金（42377133）和辽宁省重点研发计划（2023JH2/101700354）的支持。