综述:当前用于检测樟疫霉的方法综述

【字体: 时间:2025年06月24日 来源:Fungal Biology Reviews 5.7

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  这篇综述系统回顾了2011-2025年间樟疫霉(Phytophthora cinnamomi)的检测方法,涵盖环境采样(土壤/根系/植物组织)、诱饵法(baiting)、培养分离(PARP/V8A等培养基)和分子鉴定(ITS/PCR)三大流程,并提出了基于实验室资源与时间的决策流程图,为防控这种毁灭性植物病原体提供方法论指导。

  

引言

樟疫霉(Phytophthora cinnamomi)作为卵菌纲的植物病原体,可引发根系腐烂和茎干溃疡,导致近5000种植物死亡。其复杂的生命周期(包括厚垣孢子、卵孢子和游动孢子)和人类活动传播途径,使其成为农业、林业和生态系统的重大威胁。目前尚无根除方法,因此精准检测成为管理策略的核心。

方法

通过Scopus和Web of Science检索2011-2025年文献,筛选出61篇核心论文及128篇方法学参考文献,系统分析采样策略(直接/间接)、实验室诱饵、培养分离和分子确认流程。

环境采样

直接采样

  • 土壤:46项研究采集300-4000g样本,深度达300mm,通过筛分去除杂质后冷冻或直接分析。
  • 根系:27项研究采用表面灭菌(70%乙醇或1%次氯酸钠)后切割成1-10mm片段,直接培养或DNA提取。
  • 植物组织:28项研究针对坏死叶片/茎干,灭菌后接种选择性培养基(如PARPH-V8)。

间接诱饵法

  • 使用羽扇豆(Lupinus angustifolius)或杜鹃叶片作为诱饵,土壤与水按1:3比例混合,20-25°C下孵育3-14天,促进游动孢子感染诱饵。

实验室检测

培养分离

  • 培养基:V8汁琼脂(26项)、PDA(27项)和CMA(16项)最常用,添加抗生素(如Pimaricin5ARPNH)抑制杂菌。
  • 形态鉴定:菌落呈花瓣状(PDA)或无纹(V8A),显微镜下可见无乳突的孢子囊(40-70μm)和厚垣孢子。

分子确认

  • ITS区域扩增(60项研究)为主,辅以COX-1/NAD9基因分析。快速RPA-LFD技术将检测时间缩短至2小时。

决策流程

根据资源与目的选择路径:

  1. 快速筛查:直接分子检测(1-2天,但假阴性风险高);
  2. 高灵敏度:土壤诱饵+培养(6-24天,可分离活体病原);
  3. 综合确认:培养后ITS测序(金标准)。

挑战与展望

当前局限包括:

  • 土壤异质性导致的假阴性;
  • 形态鉴定需专业训练;
  • 分子检测成本高昂。
    未来可通过高通量测序(HTS)和等温扩增技术提升效率。

结论

多方法联用(如诱饵法+PARP培养基+ITS-PCR)能显著提升樟疫霉检测可靠性,为全球生态保护和农业管理提供关键技术支持。

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