基于泛基因组网络的鲍曼不动杆菌分析揭示保守治疗靶点图谱

【字体: 时间:2025年06月25日 来源:Molecular Diversity 3.9

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  为解决鲍曼不动杆菌(Acinetobacter baumannii)多重耐药性难题,研究人员通过泛基因组分析技术对124株耐药菌株展开研究,鉴定出核心基因组中与β-内酰胺酶(beta-lactamase)和多药外排泵(multidrug efflux pump)相关的关键靶点簇(cluster-288/566)。通过3D建模和分子动力学模拟证实靶点蛋白(如AdeK亚基和β-内酰胺酶)的高稳定性(RMSD 0.52-0.85 nm),为抗耐药菌药物设计提供了新方向。

  

随着鲍曼不动杆菌(Acinetobacter baumannii)感染率攀升,其多重耐药性(MDR)成为全球公共卫生危机。一项基于124株耐药菌株的泛基因组(pangenome)分析揭示了核心基因组中两个关键靶点簇:编码β-内酰胺酶(cluster-288)和多药外排泵(cluster-566)的基因簇。通过存在/缺失变异(PAV)分析发现97个耐药基因,其中青霉素结合蛋白(PBPs)和外膜通道蛋白AdeK被锁定为潜在药物靶点。

研究团队采用分子动力学(MD)模拟技术,测得β-内酰胺酶和AdeK蛋白的均方根偏差(RMSD)分别为0.85 nm和0.52 nm,证实其在生理条件下的结构稳定性。主成分分析(PCA)进一步揭示这些蛋白特有的运动模式,为理解其功能动力学提供新视角。该发现为破解"超级细菌"耐药难题提供了结构生物学基础,推动靶向抗菌药物的创新设计。

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