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肠道菌群高阶互作机制解析及关联规则挖掘在疾病分类中的应用
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年06月25日 来源:Science China Life Sciences 8
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针对传统微生物组分析方法仅关注二元关系的局限,来自未知机构的研究人员利用关联规则挖掘(ARM)技术,基于curatedMetagenomicData(CMD)数据库中2,815例健康人群和1,499例患者(IBD/CRC/IGT/T2D2)的宏基因组数据,系统揭示了肠道菌群高阶互作网络,证实ARM可显著提升疾病分类模型性能,为微生物组-宿主互作研究提供了新范式。
人体肠道内栖息着庞大而复杂的微生物群落,这些微小生命体与宿主健康息息相关。传统共现分析和相关性研究往往局限于微生物两两之间的关系,却忽视了更复杂的高阶相互作用。数据挖掘领域的关联规则挖掘(Association Rule Mining, ARM)技术为此提供了新思路,但既往研究受限于样本量不足和分类学分辨率低下。
这项研究构建了先进的ARM分析框架,利用经过标准化处理的公共数据库curatedMetagenomicData(CMD)中的大规模人类微生物组数据,对2,815名健康个体的肠道菌群进行深度解析。通过对比炎症性肠病(IBD, n=768)、结直肠癌(CRC, n=368)、糖耐量受损(IGT, n=199)和2型糖尿病(T2D2, n=164)患者的菌群特征,研究人员不仅绘制出健康人群的微生物互作网络,更揭示了疾病状态下特有的菌群关联规则。
令人振奋的是,ARM技术被证明是高效的生物标志物筛选工具。当这些挖掘出的关联规则被应用于疾病分类模型时,显著提升了诊断准确性。该研究如同为微生物组研究安装了"高维雷达",首次系统捕捉到肠道菌群中隐藏的多物种协同作用模式,为开发基于微生物组的精准诊疗策略奠定了理论基础。
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