基于质谱质量图谱的SARS-CoV-2病毒变异进化轨迹与突变位点解析

研究人员通过构建基于质谱质量图谱数据的蛋白质系统发育树，首次实现从2019年原始毒株到当前变异株的SARS-CoV-2进化轨迹精准追踪。该研究创新性地在单次建树过程中同步解析刺突蛋白(S蛋白)单点突变位点，规避传统测序与序列比对步骤，为快速变异的呼吸道病毒研究提供互补性新策略。这项技术可广泛应用于蛋白质进化研究领域。

　　

这项突破性研究开辟了病毒进化追踪的新范式。通过质谱(MS)生成的质量图谱数据，科研团队成功构建了SARS-CoV-2冠状病毒的蛋白质系统发育树，首次实现从2019年原始毒株到当前流行变异株的完整进化路径可视化。更令人振奋的是，该方法在单次建树过程中就能同步捕捉刺突蛋白(Spike protein)上的关键氨基酸突变位点，像分子考古学家一样精准还原病毒的变异历史。

与传统基因组测序相比，这种基于质谱的蛋白质组学策略巧妙避开了繁琐的序列比对步骤，直接利用实验室常规蛋白质鉴定数据即可快速实施。对于SARS-CoV-2这类快速变异的呼吸道病毒而言，该技术犹如安装了一个实时进化追踪器，能有效突破传统系统发育分析的瓶颈。研究证实，这种创新方法不仅适用于冠状病毒研究，更为所有生物的蛋白质进化研究提供了普适性解决方案——从病毒表面蛋白的细微突变到物种间保守蛋白的宏观演化，质谱质量图谱都能解码其中隐藏的分子进化密码。