约旦耐碳青霉烯类鲍曼不动杆菌临床分离株的遗传多样性及系统发育分析揭示新型序列型与区域流行特征

本研究针对耐碳青霉烯类鲍曼不动杆菌(CRAB)在约旦医院的高流行现状，采用多位点序列分型(MLST)技术对107株临床分离株进行基因分型。发现11种序列型(ST)，包括3个新型ST(ST2528/2529/2530)和5个首次在约旦报告的ST(ST2125/708/164/969/717)，其中ST2125为优势菌株(35%)。通过生物信息学分析揭示0.6%-1.6%的序列多样性，系统发育树显示新型ST与本地ST2/600存在遗传关联。该研究为CRAB医院感染防控提供了分子流行病学依据，成果发表于《Acta Tropica》。

　　

在重症监护病房的白色墙壁背后，潜藏着一种被称为"医院噩梦"的超级细菌——耐碳青霉烯类鲍曼不动杆菌(CRAB)。这种革兰阴性菌不仅能在外科器械、呼吸机等表面存活数月，更对除多粘菌素外的大多数抗生素产生耐药性。全球数据显示，每1000名住院患者中就有56人感染CRAB，而在约旦这个地中海东岸国家，这个数字达到33例。更令人担忧的是，邻近的埃及和伊朗分别报告了98%和85.1%的恐怖耐药率。这种被世界卫生组织列为"关键优先级病原体"的超级细菌，正通过复杂的基因变异机制不断进化，使得传统防控措施收效甚微。

为破解CRAB在约旦的传播密码，Hashemite大学的研究团队开展了一项开创性研究。他们从伊斯兰医院和Prince Hamzah医院收集了2018-2020年间的107株CRAB临床分离株，这些样本主要来自ICU患者的痰液(69.1%)和伤口分泌物(11.3%)，患者平均年龄43.8岁且以男性为主(64.5%)。研究采用多位点序列分型(MLST)技术，通过PCR扩增7个看家基因(cpn60/fusA/gltA/pyrG/recA/rpIB/ropB)，结合MEGA 12和PhyloViz 2.0软件进行系统发育分析，首次绘制出约旦CRAB的完整基因图谱。

分子分析显示，这些菌株呈现出惊人的遗传多样性：
• 鉴定出11种序列型，包括3个全新ST(ST2528-2530)和5个首次在约旦发现的ST(ST2125/708/164/969/717)
• 发现3个新等位基因：fusA⁴⁴⁴、fusA⁴⁴⁵和recA⁵⁰²
• ST2125成为最流行菌株(占35%)，其次是本地常见ST2(19%)和ST600(15%)

定量生物信息学分析揭示：
• 等位基因多样性率0.6%-1.6%，其中recA基因多样性最高(1.6%)
• 每个基因座检测到1-6个多态位点，gltA基因变异最显著(6个位点)
• SNP频率范围0.3%(pyrG)-1.6%(recA)

系统发育分析呈现三个关键发现：

1. 新型ST2528/2529与本地流行ST2/600存在遗传关联
2. ST2530呈现独立进化分支
3. goeBURST算法显示所有新型ST均起源于ST1862克隆复合体

讨论部分指出，约旦CRAB种群同时存在本土进化与全球传播特征：
• ST2125首次在约旦检出，此前仅印度报告过14例，提示国际传播可能
• ST2的持续流行反映其在地中海地区的特殊适应性
• ST600在约旦和利比亚的共存现象，可能与区域医疗旅游有关

这项研究首次系统揭示了约旦CRAB的分子流行病学特征，为医院感染溯源提供了重要分子标记。发现的3个新ST和3个新等位基因已录入PubMLST国际数据库。作者强调，监测ST2125等新兴菌株的传播动态，对遏制CRAB在医疗机构的暴发具有关键意义。未来需要扩大采样范围至环境标本，并整合耐药基因分析以完善防控策略。