代谢组全基因组孟德尔随机化揭示循环代谢物与1型糖尿病的因果关联

【字体: 时间:2025年06月25日 来源:eBioMedicine 9.7

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  本研究通过两样本孟德尔随机化(MR)方法,系统分析了1679种循环代谢物与1型糖尿病(T1D)的因果关联。研究人员整合7项欧洲人群代谢组GWAS和跨种族T1D GWAS数据,发现46种代谢物与T1D显著相关,其中14种在独立队列中验证。关键发现包括酪氨酸代谢通路中的香草乳酸(vanillactate)通过TH基因eQTL机制对T1D具有显著保护作用(OR=0.028)。该研究首次在基因组层面证实特定代谢物对T1D发病的因果影响,为疾病机制研究和靶向干预提供新方向。

  

1型糖尿病(T1D)是一种严重威胁人类健康的自身免疫性疾病,其特征是胰岛素生成β细胞被免疫系统错误攻击,导致患者终身依赖胰岛素治疗。尽管过去研究已发现超过100个遗传位点与T1D风险相关,但环境因素与遗传背景如何共同致病仍是未解之谜。特别值得注意的是,代谢紊乱既是T1D的结果,也可能是疾病发生的驱动因素——这一"鸡与蛋"的难题长期困扰着研究人员。传统观察性研究无法区分这种双向关系,而开展大规模随机对照试验来验证数百种代谢物的作用又面临伦理和成本的限制。

正是在这一研究瓶颈下,来自加拿大麦吉尔大学等机构的研究团队创新性地采用孟德尔随机化(Mendelian Randomization, MR)这一"天然随机对照试验"方法,系统探索了循环代谢物与T1D的因果关系。这项发表在《eBioMedicine》的研究,通过整合7项大规模代谢组全基因组关联研究(GWAS)和6项跨种族T1D GWAS数据,对1679种代谢物进行了全面分析,最终鉴定出多个具有因果效应的代谢标志物,其中酪氨酸代谢通路中的香草乳酸(vanillactate)展现出最强的保护作用。

研究团队运用了多项关键技术:两样本MR分析框架(包括Wald Ratio和IVW方法)、跨群体遗传数据整合(欧洲和东亚人群)、共定位分析(colocalisation)验证共享因果变异、LD评分回归评估遗传相关性,以及反向MR排除反向因果关系。样本来源于公开GWAS数据库,包括Kettunen等(24,925人)代谢组数据和Chiou等(520,580人)T1D数据。

【Mendelian randomisation】部分结果显示,在Bonferroni校正后,46种代谢物与T1D风险显著相关(P<2.97×10-5)。其中14种在独立数据集中成功验证,包括香草乳酸在3个T1D GWAS中均显示显著保护作用(OR范围0.028-0.210)。值得注意的是,香草乳酸的SNP工具rs113945618同时是TH基因的表达数量性状位点(eQTL),而TH基因又与T1D关键基因INS共表达。

【Colocalisation】分析进一步证实,7种代谢物(如香草乳酸、3-甲氧基酪氨酸等)与T1D共享因果变异(H4>0.8)。特别是香草乳酸所在染色体11区域与T1D风险位点存在显著共定位,支持其生物学合理性。

【LD score regression】显示香草乳酸(rG=0.46)和CMPF(rG=-0.70)与T1D存在全基因组水平的遗传相关性(P<0.01),排除了局部假阳性可能。

【Reverse MR】方向性检验确认代谢物变化驱动T1D风险的因果关系方向。Steiger检验和反向MR分析均支持主要结果不受反向因果干扰。

【Pathway analyses】通路分析揭示3种关键代谢物(香草乳酸、3-甲氧基酪氨酸、肉豆蔻酰肉碱)富集于酪氨酸代谢通路。其中香草乳酸作为L-多巴代谢产物,其保护效应可能通过调节多巴胺信号影响免疫稳态。

在讨论部分,研究者系统阐释了这些发现的科学价值。香草乳酸作为酪氨酸代谢通路的关键节点,其SNP工具位于TH基因附近,而该基因编码的酪氨酸羟化酶正是多巴胺合成的限速酶。这一发现将神经递质代谢与自身免疫疾病联系起来,为理解T1D发病机制提供了全新视角。同时,1,6-脱水葡萄糖(左旋葡聚糖)的促病作用与临床观察一致,其在年轻发病患者中水平升高。肉豆蔻酰肉碱(C14)的保护效应则支持了既往关于肉碱缺乏与胰岛素抵抗关联的假说。

这项研究的突破性在于:首次在全代谢组水平建立T1D的因果代谢网络;发现酪氨酸代谢通路的关键调控作用;为开发基于代谢干预的预防策略提供靶点。研究者建议未来在NOD小鼠模型和自身抗体阳性人群中验证这些代谢物的干预效果,推动从基因发现到临床转化的完整研究链条。这些发现不仅深化了对T1D发病机制的理解,也为其他自身免疫疾病的代谢调控研究提供了方法学范式。

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