番茄(Solanum lycopersicum L.)中乙醇酸氧化酶(GLO)基因家族的全基因组鉴定与分析:揭示其在生物胁迫和果实发育中的多重作用

【字体: 时间:2025年06月26日 来源:Discover Plants

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  本研究针对番茄生产中面临的生物胁迫和果实品质提升需求,通过全基因组分析鉴定了6个乙醇酸氧化酶(GLO)基因家族成员,系统解析了其进化关系、表达模式及功能。研究发现SIGLO基因通过调控H2O2信号通路参与抗病响应和果实发育,其中SIGLO4/6在抗病品种中显著上调,SIGLO1/3在果实成熟期高表达。该研究为番茄抗逆育种和品质改良提供了重要靶点。

  

研究背景与意义
番茄作为全球第三大蔬菜作物,其产量和品质常受病原体侵袭威胁。乙醇酸氧化酶(Glycolate oxidase, GLO)是光呼吸代谢中的关键酶,催化乙醇酸氧化生成乙醛酸和H2O2,后者既是活性氧分子(ROS)又参与防御信号传导。尽管GLO在拟南芥、水稻等作物中的功能已有研究,但番茄GLO基因家族的系统分析及其在生物胁迫和果实发育中的作用仍属空白。

研究设计与方法
巴基斯坦拉合尔旁遮普大学的研究团队通过生物信息学结合实验验证,开展了以下工作:

  1. 基于FMN_dh结构域(PF01070)鉴定番茄GLO家族成员
  2. 系统进化、基因结构和共线性分析揭示家族进化特征
  3. 启动子顺式元件预测解析调控网络
  4. 转录组和qRT-PCR分析基因时空表达模式
  5. 抗病品种比较分析明确SIGLOs的胁迫响应机制

主要研究结果
3.1 GLO基因家族鉴定与特征
通过全基因组筛选鉴定出6个SIGLO基因,分子量24.96-40.68 kDa,等电点6.76-9.04。染色体定位显示3个基因(SIGLO1-3)串联排列于3号染色体,提示串联复制是家族扩张的主要驱动力。

3.2 进化与结构分析
系统发育将20个植物GLO蛋白分为3组:A组含SIGLO4/6与拟南芥AtGOX1-3;B组含SIGLO1-3与AtHAOX1-2;C组仅含SIGLO5。Motif分析发现所有成员均含FMN_dh结构域(Motif 1),B组特有Motif 7可能与胁迫响应相关。

3.3 表达模式解析

  • 发育调控:SIGLO1/3在红熟期果实高表达,SIGLO6在绿果期活跃
  • 抗病响应:接种Pyrenochaeta lycopersici后,抗病品种Mogeor中SIGLO4/6表达显著上调
  • 营养改善:菌根共生显著提升SIGLO4/5在果实中的表达水平

3.4 调控机制
启动子分析发现75个顺式元件,包括:

  • 胁迫响应元件:MYB、MYC、TC-rich repeats
  • 激素响应元件:ABRE(脱落酸)、TGA-element(生长素)
  • 光响应元件:G-box、I-box

结论与展望
该研究首次系统阐明了番茄GLO基因家族的进化特征和功能分化,揭示SIGLO4/6通过H2O2信号通路增强抗病性,而SIGLO1/3调控果实成熟品质。研究为番茄分子设计育种提供了新靶点,未来可通过基因编辑等技术验证各成员的具体功能。论文成果发表于《Discover Plants》,对理解植物GLO基因的多效性具有重要理论价值。

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