城市化对肠道微生物组的影响：基于加州安娜蜂鸟(Calypte anna)的生态解析

为探究城市化对野生动物肠道微生物组的影响，研究人员以加州安娜蜂鸟(Calypte anna)为模型，通过16S rRNA V1-V3高通量测序和QIIME2平台分析，揭示了空气质量、人工光源及人类活动强度等环境因子与微生物组多样性间的显著关联，为城市生态健康评估提供了新视角。

　　

城市化进程如何塑造野生动物的肠道微生物组？加州安娜蜂鸟(Calypte anna)这一同时活跃于城乡环境的物种成为理想研究对象。通过对其粪便样本中细菌16S rRNA基因V₁-V₃可变区的高通量测序，结合QIIME2生物信息学分析平台，研究团队系统解析了不同城市化梯度下（包括夜间人工光照强度、人口密度、空气污染指数及地表不透水率等参数）微生物群落结构的动态变化。

结果表明，空气质量参数与微生物α多样性呈显著相关性，而城市景观异质性会特异性富集某些功能菌群。该发现不仅拓展了野生鸟类作为生态系统健康"生物指示物"(bioindicators)的应用维度，更为理解人类活动对野生动物-微生物共生网络的干扰机制提供了实证依据。值得注意的是，研究采用的16S rRNA扩增技术可精准识别厚壁菌门(Firmicutes)和拟杆菌门(Bacteroidetes)等关键菌群，这些微生物类群与宿主的营养代谢、免疫调节等生理过程密切相关。