基于代理模型的肝母细胞瘤治疗模拟:免疫系统与化疗协同作用的计算生物学研究

【字体: 时间:2025年06月26日 来源:Computer Methods and Programs in Biomedicine 4.9

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  针对肝母细胞瘤(HB)晚期及复发缺乏有效疗法的临床难题,研究团队通过增强型代理模型(ABM)C-ImmSim,首次整合癌症细胞动力学、免疫响应(IS)与化疗作用,模拟5000例虚拟患者三年病程。结果成功复现临床死亡率(3年OS)、症状发作率及转录组亚型特征,为个体化儿科治疗(in silico trials)提供创新研究平台。

  

肝母细胞瘤(HB)作为儿童最常见的肝脏恶性肿瘤,占小儿肝肿瘤的80%,其治疗困境始终悬而未决。尽管化疗联合手术是标准疗法,但对复发和晚期病例效果有限,五年生存率不足40%。更棘手的是,肿瘤异质性和免疫微环境相互作用的复杂性,使得传统研究方法难以捕捉动态演变过程。这一背景下,计算生物学为破解难题提供了新思路——通过计算机模拟再现疾病全过程,或许能发现传统实验无法揭示的机制。

来自iPC国际儿科联盟的研究团队选择了一种名为C-ImmSim的代理模型(Agent-Based Model, ABM)作为突破口。这种模型通过模拟数百万个自主决策的"代理"(即虚拟细胞和分子),能动态呈现免疫细胞与肿瘤细胞的博弈过程。研究创新性地将HB特异性特征植入模型,包括肿瘤生长速率(0.025天?1的Logistic曲线)、化疗敏感性参数(源自临床数据),并首次实现了免疫治疗与化疗的协同模拟。论文发表于《Computer Methods and Programs in Biomedicine》,标志着计算肿瘤学在儿科领域的重要突破。

关键技术包括:1) 扩展C-ImmSim框架以模拟HB特异性细胞行为;2) 基于iPC联盟临床数据校准模型参数;3) 构建5000例虚拟患者队列,模拟三年病程;4) 整合化疗细胞死亡概率模型;5) 通过转录组数据验证肿瘤亚型分类。

【ABM用于临床结果模拟】
通过模拟未治疗组,研究复现了化疗前时代HB患者100%死亡率的历史数据,验证了模型可靠性。治疗组模拟显示,标准疗法能使3年总生存期(OS)达到临床观察值,且肿瘤体积增长曲线与真实病例高度吻合。值得注意的是,模型捕捉到免疫细胞浸润程度与预后呈显著正相关。

【讨论】
该研究首次实现四大突破:1) 在人类HB模型中同时整合细胞动力学、免疫响应和化疗;2) 通过大规模虚拟队列再现临床异质性;3) 揭示免疫微环境动态变化规律;4) 建立可扩展的计算平台。特别是模型能实时监测白介素(IL-2)、干扰素(IFN-γ)等关键细胞因子的时空分布,为理解免疫逃逸机制提供新视角。

【结论】
这项研究不仅验证了ABM在复杂疾病建模中的可行性,更开创了个体化儿科医疗的新范式。通过"数字孪生"技术,未来可预先测试不同治疗方案,大幅降低临床试验风险。作者团队特别指出,模型中免疫检查点分子的动态变化数据,将为下一代免疫疗法开发提供重要线索。正如通讯作者Filippo Castiglione强调的:"这是首次将计算免疫学、临床肿瘤学和儿科研究完美融合的尝试,其方法论意义远超肝母细胞瘤本身。"

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