环境来源Nakaseomyces glabratus D77_3菌株近完成基因组测序揭示其从生态位到致病性的进化机制

来自保加利亚的研究团队针对机会性酵母病原体Nakaseomyces glabratus（原Candida glabrata）的生态适应性机制，通过PacBio+Illumina双平台测序技术完成环境分离株D77_3的高质量基因组组装（12.65 Mb，N50=1,058,520 bp），揭示其染色体结构变异（4号与12号染色体重排）及端粒重复序列特征，为理解该病原体从甲虫肠道生态位向人类血液感染的宿主转换提供关键分子证据。

　　

保加利亚科学家从甲虫Oxythyrea funesta肠道中分离出一株环境来源的Nakaseomyces glabratus（原Candida glabrata）D77_3菌株，这种机会性酵母病原体正是导致免疫缺陷患者致命性血流感染（念珠菌血症）的元凶。研究团队采用Maxwell RSC组织DNA提取试剂盒获取高质量基因组DNA，通过PacBio长读长（145,092条subreads）与Illumina短读长（16,454,074条Q30≥95.88% reads）双平台测序策略，结合HGAP3组装和Pilon三轮抛光，最终获得包含15个contig的12.65 Mb高质量基因组。

有趣的是，在contig 1/5/8两端均检测到端粒特征序列TCTGGGTGCTGTGGGG，暗示这些contig代表完整染色体。与参考基因组GCF_000002545.3比对发现，该菌株存在4号与12号染色体的结构性重排（涉及contig 2/12/13）。BUSCO评估显示99.13%的基因组完整性，182.27×的平均测序深度确保数据可靠性。这些发现为揭示该病原体从甲虫肠道环境向人类血液环境跳跃的进化密码提供了重要线索。

该菌株已保藏在保加利亚国家微生物保藏中心（NIMCC 9134），其基因组数据将助力科学家破解"环境菌→致病菌"转变的分子开关。研究获得保加利亚国家科学基金KP-006-H31/19项目资助。