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综述:细菌细胞壁组分作为新型抗菌化合物靶点的研究方法
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年06月27日 来源:Molecular Biology 1.5
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(编辑推荐)本综述系统阐释了细菌细胞壁关键组分(如酶、受体、转运蛋白及孔道蛋白Porins)作为抗生素靶点的分子机制,重点解析了革兰氏阴性菌外膜孔蛋白(OMPs)的抗生素渗透机制及耐药性对策,为开发克服耐药性的新策略提供理论框架。
抗生素耐药性已成为威胁人类健康和粮食安全的全球性问题。细菌细胞壁(除支原体外)作为独特的结构靶点,其组分如肽聚糖合成酶、青霉素结合蛋白(PBPs)、孔蛋白(Porins)等,在抗生素开发中具有核心价值。革兰氏阴性菌外膜中的孔道蛋白(如OmpF/OmpC)通过调控抗生素渗透参与耐药性形成,其三维结构特征为优化药物分子设计提供了关键依据。
肽聚糖层是绝大多数细菌细胞壁的刚性骨架,其合成途径中的转肽酶(如PBP2/PBP3)是β-内酰胺类抗生素的经典靶点。研究发现,金黄色葡萄球菌PBP2a的变构位点可被新型双环硼酸酯化合物抑制,这为克服MRSA耐药性开辟了新途径。脂多糖(LPS)合成酶LpxC在革兰氏阴性菌中高度保守,其锌离子结合域的小分子抑制剂已进入临床前研究阶段。
外膜孔蛋白(如大肠杆菌OmpF)的β-桶状结构形成1nm级通道,其电荷分布和孔径大小直接影响四环素类药物的跨膜效率。耐多药铜绿假单胞菌通过下调OprD表达导致碳青霉烯类抗生素内流减少,而OmpK36的loop3区突变会缩小通道截面积,从而阻碍美罗培南的渗透。冷冻电镜技术揭示了孔蛋白与抗生素的动态结合模式,为改造药物分子极性提供了结构生物学基础。
表面等离子共振(SPR)和差示扫描量热法(DSC)可实时监测PBP与β-内酰胺的相互作用动力学。针对LpxC开发的高通量荧光报告系统,通过检测UDP-3-O-(R-羟基十四烷酰)-N-乙酰葡糖胺的积累实现酶活定量。最近发展的冷冻电子断层扫描(cryo-ET)技术能在近生理状态下解析细胞壁合成酶的超分子组装机制。
基于结构指导的杂合抗生素设计(如将头孢菌素骨架与孔蛋白穿透增强基团偶联)显示出突破外膜屏障的潜力。针对鲍曼不动杆菌Bam复合体的单克隆抗体可破坏β-桶状蛋白折叠,使细菌对多粘菌素敏感性提升8倍。人工智能辅助的虚拟筛选已鉴定出可同时抑制PBP2和L,D-转肽酶的双功能抑制剂先导化合物。
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