异荭草素与荭草素抑制脲酶的分子机制:酶动力学、光谱表征与分子对接研究

【字体: 时间:2025年06月27日 来源:International Journal of Biological Macromolecules 7.7

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  针对幽门螺杆菌(H. pylori)感染治疗靶点脲酶(urease)的抑制需求,研究人员以天然黄酮类化合物异荭草素(isoorientin)和荭草素(orientin)为研究对象,通过酶动力学、光谱学及分子 docking 技术揭示其混合型抑制机制。结果表明,两者通过氢键、疏水作用等改变脲酶构象,IC50分别为63.42 μM和71.61 μM,为开发低毒天然抑制剂及功能性食品提供科学依据。

  

幽门螺杆菌(H. pylori)感染是全球约50%人口面临的健康威胁,尤其在发展中国家呈上升趋势。这种细菌依赖其分泌的脲酶(urease)在胃酸环境中存活,通过分解尿素产生氨(NH3)中和胃酸,进而引发胃炎、胃溃疡甚至胃癌。尽管现有合成脲酶抑制剂(如羟基脲、硫脲衍生物)可阻断脲酶活性,但毒性大、稳定性差等问题限制了临床应用。因此,从天然产物中发掘高效低毒的脲酶抑制剂成为研究热点。

贵州某研究团队以药用植物Polygonum orientale L.中的两种C-糖基化黄酮——异荭草素(isoorientin)和荭草素(orientin)为研究对象,首次系统评估其对脲酶的抑制机制。研究采用酶动力学分析、荧光猝灭(fluorescence quenching)、同步荧光(synchronous fluorescence)、圆二色谱(circular dichroism)及分子对接(molecular docking)等技术,揭示了两种化合物通过改变脲酶构象实现抑制的分子基础。论文发表于《International Journal of Biological Macromolecules》。

关键方法

  1. 体外抑制活性测定:通过脲酶-尿素反应体系测定IC50
  2. 酶动力学分析:Lineweaver-Burk双倒数图判断抑制类型;
  3. 光谱技术:静态猝灭机制分析结合常数,同步荧光和三维荧光检测酶微环境变化,圆二色谱解析二级结构改变;
  4. 分子对接:AutoDock模拟化合物与脲酶活性位点结合模式。

研究结果

1. 体外抑制活性与动力学机制
异荭草素和荭草素对脲酶的IC50分别为63.42±1.80 μM和71.61±3.35 μM,抑制率最高达74.63%和75.48%。动力学分析显示两者均为混合型抑制剂,既可竞争性占据活性中心,又能通过非竞争方式干扰酶催化。

2. 光谱学相互作用
静态猝灭实验表明,两者通过氢键(异荭草素)或疏水作用(荭草素)与脲酶结合,形成稳定复合物。同步荧光显示色氨酸(Trp)残基微环境极性增强,提示酶活性中心构象改变;圆二色谱证实α-螺旋含量下降,导致酶失活。

3. 分子对接验证
异荭草素结合能(-6.42 kcal/mol)优于荭草素(-5.73 kcal/mol),主要与脲酶His492、Ala440等残基形成氢键网络,而荭草素则更多依赖疏水腔(如Leu523)结合。

结论与意义
该研究首次阐明异荭草素和荭草素通过多机制协同抑制脲酶:①直接竞争活性位点;②诱导酶构象变化;③破坏镍离子(Ni2+)配位环境。这不仅为Polygonum orientale L.开发为抗H. pylori功能性食品提供理论支撑,更为设计低毒、高稳定性的天然脲酶抑制剂开辟新思路。未来可进一步优化结构以提高结合特异性,或探索与其他抗菌成分的协同效应。

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