磺酰基-γ-AApeptide模拟混合谱系白血病蛋白靶向CREB结合蛋白界面的突破:超越MLL仿生策略

【字体: 时间:2025年06月28日 来源:Journal of Medicinal Chemistry 6.9

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  针对混合谱系白血病(MLL)与CREB结合蛋白(CBP/p300)KIX结构域相互作用(PPI)在白血病、阿尔茨海默病等疾病中的关键作用,研究人员设计基于磺酰基-γ-AApeptide骨架的螺旋折叠体,成功模拟MLL转录激活域(TAD)并高亲和力结合KIX,显著激活CREB依赖性基因表达,为神经退行性疾病靶向治疗提供新策略。

  

在转录调控的复杂网络中,CREB结合蛋白(CBP)及其同源物p300作为"分子桥梁"发挥着核心作用。其中KIX结构域作为关键接口,通过与混合谱系白血病蛋白(MLL)等转录因子的相互作用,调控造血系统发育和神经功能。然而,MLL-KIX相互作用的异常与白血病、阿尔茨海默病等重大疾病密切相关,这使得靶向该蛋白-蛋白相互作用(PPI)界面成为治疗新思路。但传统多肽药物存在稳定性差、易降解等问题,亟需开发新型仿生分子。

针对这一挑战,中国科学院上海药物研究所的研究团队创新性地采用磺酰基-γ-AApeptide非天然氨基酸骨架,设计出一系列具有螺旋构象的折叠体。这些合成分子成功模拟了MLL蛋白的转录激活域(TAD)三维结构,通过核磁共振(NMR)和等温滴定量热法(ITC)证实其与KIX结构域的结合亲和力达到纳摩尔级别。尤为重要的是,这些折叠体不仅能阻断MLL-KIX相互作用,还可变构增强CREB信号通路,在报告基因实验中使CREB依赖性基因表达提升3-5倍。通过MTT实验证实,这些分子在有效浓度范围内未显示细胞毒性,展现出良好的成药性特征。该研究发表于《Journal of Medicinal Chemistry》,为神经退行性疾病的靶向治疗提供了全新分子工具。

关键技术方法包括:1)基于结构设计的磺酰基-γ-AApeptide固相合成;2)圆二色谱(CD)验证螺旋构象;3)表面等离子共振(SPR)测定结合动力学;4)转基因细胞系进行CREB报告基因检测;5)人原代细胞毒性评估。

研究结果:

  1. 分子设计:通过计算机模拟MLL-TAD的α螺旋特征,将关键结合残基移植到磺酰基-γ-AApeptide骨架,获得具有稳定310螺旋构象的折叠体。
  2. 结合特性:ITC测定最佳化合物Kd=87 nM,较天然MLL肽段提高10倍,X射线晶体学揭示其结合模式与MLL高度相似。
  3. 功能调控:折叠体通过变构效应使CREB与KIX结合自由能降低2.3 kcal/mol,荧光素酶报告基因活性提升420%。
  4. 选择性验证:竞争性实验显示折叠体对KIX的抑制IC50=0.8 μM,而对其他CBP结构域无显著影响。

结论与意义:
该研究首次证明磺酰基-γ-AApeptide可精确模拟天然蛋白的螺旋界面,突破传统多肽药物的局限性。通过同时阻断MLL信号和增强CREB通路,这些折叠体为阿尔茨海默病等神经退行性疾病提供了"一石二鸟"的治疗策略。其独特的变构调控机制为PPI靶向药物开发开辟了新方向,未来或可拓展至其他依赖CBP/p300的疾病领域。研究建立的"结构仿生-功能超越"设计理念,为人工蛋白模拟物的开发提供了范式转移。

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