低温氩基质中2-硒尿嘧啶的UV诱导转化与氢原子隧穿效应研究

【字体: 时间:2025年06月28日 来源:Spectrochimica Acta Part A: Molecular and Biomolecular Spectroscopy 4.3

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  研究人员针对2-硒尿嘧啶(2-selenouracil)在低温Ar基质中的光化学行为展开研究,通过UV照射(λ>345 nm和λ=305 nm)诱导其从稳定氧-硒酮形式(oxo-selenone)转化为高能氧-硒醇(oxo-selenol)及羟基-硒醇(hydroxy-selenol)形式,并首次观测到氢原子隧穿驱动的自发逆向转化(时间常数39±3 h)。该研究通过红外光谱与DFT/MP2理论计算结合,揭示了硒修饰核酸碱基的动态特性,为理解硒代嘧啶在氧化应激中的可逆调控机制及tRNA修饰功能提供了新视角。

  

在生命科学领域,硒(Se)作为必需微量元素,其独特的化学性质使其在核酸修饰中扮演关键角色。2-硒尿嘧啶(2-selenouracil)作为2-硫尿嘧啶的硒代类似物,存在于某些细菌tRNA的摆动位置(wobble position),通过增强U-G非标准配对提高翻译准确性。然而,与硫代衍生物相比,硒代嘧啶更易发生氧化还原反应,且其光化学行为与结构动态变化机制尚不明确。尤其在低温条件下,氢原子隧穿(hydrogen-atom tunneling)这类量子效应如何影响其 tautomeric(互变异构)平衡,成为理解硒生物学功能的重要科学问题。

波兰科学院分子与高分子研究中心及物理研究所的研究团队在《Spectrochimica Acta Part A: Molecular and Biomolecular Spectroscopy》发表的研究中,首次系统揭示了2-硒尿嘧啶在低温氩(Ar)基质中的UV诱导转化与自发隧穿现象。研究采用气相沉积法将2-硒尿嘧啶单体隔离于12 K的Ar基质中,通过波长特异性UV照射(λ>345 nm和λ=305 nm)触发光异构化,并利用傅里叶变换红外光谱(FTIR)结合密度泛函理论(DFT)和二阶微扰理论(MP2)计算,追踪了从稳定氧-硒酮形式(I)向氧-硒醇(II、III)和羟基-硒醇(IV)的转化路径。

关键技术方法

  1. 基质隔离技术:12 K低温Ar基质中固定单体分子;
  2. 波长可控UV照射:分阶段使用λ>345 nm(长波)和λ=305 nm(短波)光源;
  3. 红外光谱解析:实验FTIR数据与DFT/MP2计算的振动谱比对;
  4. 量子化学计算:在MP2/6-311++G(2df,2p)水平评估 tautomer 能量与势垒。

研究结果
The most stable oxo-selenone form of 2-selenouracil and its infrared spectrum
理论计算确认氧-硒酮形式(I)为最稳定 tautomer,其能量比氧-硒醇(II、III)和羟基-硒醇(IV)分别低35 kJ·mol?1、26 kJ·mol?1。实验IR谱中,C=Se伸缩振动(νC=Se)位于~1600 cm?1,与计算值高度吻合。

UV-induced transformations
长波UV(λ>345 nm)选择性将I转化为氧-硒醇II,而短波UV(λ=305 nm)进一步生成氧-硒醇III和羟基-硒醇IV。光谱特征显示,II的νC=Se消失并出现Se-H振动(~2350 cm?1),证实硒酮-硒醇 tautomerization。

Spontaneous hydrogen-atom tunneling
黑暗条件下,氧-硒醇II以39±3 h的时间常数自发回复为I,此过程需跨越~100 kJ·mol?1势垒,仅能通过氢原子隧穿解释。该现象与2-硫尿嘧啶(2-thiouracil)的隧穿速率(约50 h)相似,但硒代衍生物表现出更高的 tautomeric 多样性。

结论与意义
该研究首次证实2-硒尿嘧啶在低温下存在光驱动 tautomeric 多态性及隧穿介导的逆向转化,揭示了硒的极化性(polarizability)如何通过降低pKa(如5-甲基氨基甲基-2-硒尿苷pKa=6.43 vs. 硫代类似物7.28)影响分子动态。这一发现为理解硒代tRNA修饰(如R5Se2U)在氧化应激中的可逆调控机制提供了分子基础,并为设计响应性硒代核酸探针开辟了新思路。与硫脲(thiourea)/硒脲(selenourea)的类比研究相比,2-硒尿嘧啶展现出更复杂的 phototautomerization 路径,暗示硒在生命体系中可能具有独特的“分子开关”功能。

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