基于ddPCR的cfDNA片段组学分析揭示激素受体阳性/HER2阴性转移性乳腺癌的肿瘤动态预测新策略

针对HR+/HER2-转移性乳腺癌患者CDK4/6抑制剂耐药监测难题，意大利研究团队通过ddPCR定量分析ACTB基因片段（136/420/2000 bp），发现基线ACTBshort Q3与PR阴性（RRR 0.27）及肝转移（RRR 3.75）显著相关，且ACTBmedium Q3可独立预测PFS改善（HR 0.33）。该无创片段组学技术为肿瘤负荷动态监测提供新思路。

　　

在乳腺癌治疗领域，激素受体阳性(HR+)/HER2阴性转移性乳腺癌(MBC)占所有病例的70%以上。尽管CDK4/6抑制剂(CDK4/6i)联合内分泌治疗已成为标准一线方案，但耐药问题始终困扰临床——约10-30%患者出现原发性耐药，几乎所有患者最终都会进展。目前液体活检技术如循环肿瘤DNA(ctDNA)检测虽能监测肿瘤动态，但存在突变检出率低、成本高等瓶颈。

意大利MAGNETIC研究团队在《Translational Oncology》发表创新成果，提出基于液滴数字PCR(ddPCR)的片段组学解决方案。这项前瞻性研究纳入141例接受一线治疗的luminal型MBC患者，通过定量血浆中ACTB基因不同长度片段（136 bp短片段/420 bp中片段/2000 bp长片段），建立无突变依赖的肿瘤负荷评估体系。研究团队采集基线(BL)、3个月(T3)和6个月(T6)的血样，采用ddPCR技术检测cfDNA片段分布，结合多变量回归和生存分析探究其临床价值。

ACTB片段与基线特征关联
研究发现基线ACTB_short（短片段）第三四分位数(Q3)与PR阴性显著相关（RRR 0.27, P=0.012），且肝转移患者该片段水平更高（RRR 3.75, P=0.009）。值得注意的是，不同CDK4/6抑制剂类型（帕博西尼/瑞博西尼/阿贝西利）对应的片段分布存在显著差异（P<0.001），提示药物特性可能影响DNA释放模式。

片段动态变化规律
纵向分析显示，ACTB_short在治疗3个月时显著下降（P<0.001），但6个月时反弹至基线水平；而ACTB_medium（中片段）在3个月和6个月持续降低（P<0.01），这种动态变化与肿瘤微环境中白细胞裂解过程相关。

生存预后价值
多因素分析证实，基线ACTB_short Q3是PFS（HR 1.92, P=0.041）和OS（HR 3.94, P=0.003）的独立危险因素。相反，ACTB_medium Q3展现出保护效应，使疾病进展风险降低67%（HR 0.33, P=0.012）。12个月生存率分析进一步显示，ACTB_short Q3组OS仅87%，显著低于Q2组的100%。

方法学突破与临床意义
该研究创新性地将片段组学原理转化为临床实用工具：短片段代表肿瘤源性DNA，中长片段反映非肿瘤细胞裂解。这种分类不仅克服了传统ctDNA检测的突变依赖局限，更通过标准化ddPCR流程实现低成本、高重复性检测。特别值得关注的是，研究首次揭示非分泌型肿瘤（低ACTB_short）可能构成特殊亚群，这类患者虽ctDNA水平低但预后较差，需结合其他分子标记进一步解析。

讨论部分指出，该技术可与现有NGS方案形成互补：片段组学提供全局肿瘤负荷评估，而基因测序解析具体突变谱。作者建议将ACTB片段分析纳入风险分层体系，指导影像学监测频率调整。尽管存在样本量有限、随访时间不足等局限，这项研究为HR+ MBC的精准管理开辟了新路径，其采用的PAXgene采血管/QIAsymphony提取系统等标准化流程，更增强了结果的可转化性。未来研究可探索片段组学与表观遗传特征的联合应用，进一步提升液态活检的预测效能。