巴西野生动物蜱虫中发现新型Jingmen病毒组潜在成员——里奥普雷托蜱病毒(RPTV)的鉴定与特征分析

本研究针对蜱媒病毒多样性认知不足的现状，通过宏基因组学方法在巴西圣保罗州野生动物寄生蜱中鉴定出一种新型Jingmen病毒组病毒——里奥普雷托蜱病毒(RPTV)。研究团队从Amblyomma sculptum和A. nodosum蜱中获取病毒基因组，通过系统发育分析和结构预测证实其与已知Jingmen tick virus(JMTV)存在显著差异（遗传距离25-30%），并发现其甲基转移酶(MTase)和RNA依赖的RNA聚合酶(RdRp)存在独特变异。该发现为蜱媒病毒流行病学监测提供重要数据，对评估人畜共患病风险具有警示意义。

　　

蜱虫作为专性吸血节肢动物，是多种病原体的传播媒介，对野生动物、家畜和人类健康构成严重威胁。尽管虫媒病毒研究日益受到关注，但与蚊媒病毒相比，蜱媒病毒的认知仍存在显著空白。Jingmen病毒组作为一类新发现的蜱传病原体，其成员如Jingmen tick virus(JMTV)和Alongshan virus(ALSV)已被证实可导致人类发热性疾病，但该病毒组的多样性、宿主范围和致病机制仍有待探索。在此背景下，巴西圣保罗州立大学的研究团队在《Virus Evolution》发表论文，报道了从野生动物寄生蜱中发现的新型病毒——里奥普雷托蜱病毒(Rio Preto tick virus, RPTV)。

研究团队采用宏基因组测序、RT-qPCR验证和生物信息学分析等技术手段，对2018-2021年间从27只野生动物（包括大食蚁兽、黑簇绒狨和食蟹狐）体表采集的273只蜱虫样本进行病毒筛查。通过Illumina平台进行高通量测序，利用SPAdes软件进行基因组组装，并采用PhyML构建系统发育树。

研究结果

1. 病毒发现与基因组特征
   在4个蜱虫混合池（含A. sculptum和A. nodosum）中检测到RPTV的完整四节段基因组（总长11,789 nt），其各节段与JMTV的核苷酸相似性仅为70-75%。系统发育分析显示RPTV形成独立分支，支持其作为Jingmen病毒组新成员的地位。

2. 蛋白结构特征
   通过AlphaFold预测发现：

• NSP1蛋白：缺乏Flaviviridae家族保守的GTR连接肽，且甲基转移酶活性中心的E₂₁₇被缬氨酸取代（K-D-K-V模式），可能影响2'-O甲基化功能。
• RdRp结构域：缺失锌离子结合位点（F₄₅₇/L₄₆₁替代典型E/H/C组合），提示其催化机制可能不同于经典黄病毒。

1. 流行病学意义
   病毒阳性样本来自地理间隔85公里的两个地区，提示RPTV可能在圣保罗州西北部广泛分布。尽管未能成功分离病毒，但RT-qPCR在BHK-21细胞接种实验中检测到病毒RNA，暗示该病毒具有细胞侵入能力。

讨论与结论
该研究首次报道A. sculptum和A. nodosum作为Jingmen病毒组新成员的载体，扩展了该类病毒的已知宿主范围。结构分析揭示RPTV关键酶类的独特变异，特别是MTase活性位点的E217V突变可能影响其免疫逃逸能力，这为理解病毒与宿主的相互作用提供了新视角。鉴于Jingmen病毒组成员已在多国引起人类疾病，RPTV的发现强调了对野生动物-蜱虫病毒互作开展持续监测的必要性，为预测潜在人畜共患病风险提供科学依据。研究同时指出，未来需通过血清学调查评估该病毒在巴西人群中的暴露情况，并探索其致病机制。