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全外显子组测序揭示印度人群特应性皮炎的遗传学基础及FLG/HLA基因变异特征
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年06月28日 来源:British Journal of Dermatology 11.0
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针对印度人群特应性皮炎(AD)遗传机制数据匮乏的问题,印度昌迪加尔医学教育与研究学院团队通过全外显子组测序(WES)技术,对16例AD患者进行基因分析。研究发现FLG基因功能缺失突变(如152276761T>C)和HLA基因变异(如HLA-A 29911928C>G)与AD显著相关(P<0.001),证实表皮分化复合体与免疫调节基因在AD发病中的作用,为个性化治疗提供新依据。
特应性皮炎(Atopic Dermatitis, AD)是一种以皮肤屏障缺陷和免疫失调为特征的慢性炎症性疾病,全球约20%儿童受其困扰。尽管FLG(filaggrin)和HLA(人类白细胞抗原)等基因已被证实与AD相关,但不同人群的遗传变异谱存在显著差异。印度作为遗传多样性突出的地区,其AD遗传学研究长期空白,导致针对性治疗策略缺乏科学依据。
为解决这一问题,印度昌迪加尔医学教育与研究学院的研究团队开展了印度首项AD全外显子组测序(Whole-exome sequencing, WES)研究。团队严格筛选16例符合Hanifin-Rajka诊断标准的AD患儿,记录临床特征(包括Scoring Atopic Dermatitis评分和血清IgE水平),并采用Twist Biosciences Human Comprehensive Exome Panel进行WES检测。通过ANNOVAR进行变异注释,并与2438例对照数据库比对,最终发现FLG基因功能缺失突变和HLA基因多态性在印度AD患者中呈现显著富集。该成果发表于《British Journal of Dermatology》,为理解AD的种族特异性遗传机制提供了关键证据。
关键技术方法包括:1)基于Hanifin-Rajka标准建立印度AD患儿队列(n=16);2)采用Twist Biosciences外显子捕获联合Illumina测序平台进行WES;3)通过ANNOVAR进行变异注释及病例-对照分析(对照组n=2438);4)统计学分析采用χ2检验(显著性阈值P<0.05)。
主要研究结果
FLG基因突变与AD表型关联
在染色体1q21.3区域,63%患者携带FLG基因功能缺失突变(如152276761T>C和152276828G>A),这些突变与早发型AD(平均发病年龄36.4个月)和高IgE水平(均值6564 IU mL-1)显著相关(P<0.001),印证了皮肤屏障缺陷在AD发病中的核心作用。
HLA基因变异特征
染色体6p21.3区域的HLA变异表现出人群特异性:HLA-A 29911928C>G(81%)、HLA-DQA1 32609299A>-(44%)等位基因频率显著高于对照组,提示印度AD患者的免疫调节通路异常可能与HLA-II类分子抗原呈递功能改变密切相关。
结论与意义
该研究首次系统描绘了印度AD患者的遗传变异图谱,证实FLG和HLA基因是印度人群AD的关键遗传风险因素。特别值得注意的是,HLA变异的高频出现(如HLA-DQB1)为解释印度AD患者Th2免疫反应异常提供了新视角。研究强调WES技术在发现种族特异性遗传标记中的价值,为开发针对印度人群的AD精准诊疗策略奠定基础。未来需扩大样本量并开展功能验证,以明确这些变异如何通过表皮屏障和免疫调节网络调控AD发病。
(注:作者信息保留原文格式:Kittu Malhi、Rahul Mahajan等;专业术语如HLA-DQA1、χ2检验等均按原文规范呈现)
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