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基于图论与拓扑数据分析的肾细胞癌核空间组织特征研究
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年06月28日 来源:Computer Methods and Programs in Biomedicine 4.9
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本研究针对肾细胞癌(RCC)病理诊断中核空间组织量化难题,提出融合拓扑数据分析和图论的计算框架。通过提取Betti数(β0、β1)和聚类系数等特征,系统评估强度阈值对核聚集模式的影响,发现肿瘤组织呈现更高β1值和聚类系数(p<0.05),证实拓扑特征可有效区分RCC与正常组织,为自动化诊断提供可解释的生物标志物。
肾细胞癌(Renal Cell Carcinoma, RCC)作为最常见的肾脏恶性肿瘤,其诊断长期依赖病理医师对核形态的主观评估。尽管深度学习在医学影像分析中崭露头角,但"黑箱"特性限制了临床可解释性。更棘手的是,早期RCC的核空间组织变化微妙,传统方法难以捕捉这些预示恶性转化的拓扑特征。这种现状催生了对量化分析工具的迫切需求——既要保留生物学意义,又能客观反映核聚集模式的异常。
来自Sri Ramachandra Medical College的研究团队另辟蹊径,将数学中的拓扑数据分析和图论引入病理图像分析。他们假设:肿瘤核的混乱排布会形成特殊的连接模式,这些模式可通过Betti数(描述空间连通性的代数拓扑指标)和聚类系数(量化局部聚集程度的图论参数)精确刻画。为验证该假设,研究团队设计了一套严谨的计算流程:首先通过多阈值核分割生成不同连接程度的网络,继而用"肘部法则"确定最优分析阈值,最终利用曼-Whitney U检验比较肿瘤与正常组织的拓扑差异。
关键技术方法
研究采用8例配对RCC患者肿瘤/正常组织样本,使用Detectron2进行核分割。通过系统扫描50-150像素强度阈值范围,提取β0(连通分量数)、β1(环状结构数)和聚类系数等特征。采用肘部法则确定100像素为最优阈值,所有统计分析均在Python环境下完成。
Results
核空间拓扑特征差异
在最优阈值下,肿瘤组织表现出显著更高的β1值(1.8倍)和聚类系数(p<0.001),反映其核连接呈现更多环状结构和局部聚集。相反,正常组织的β0值高出37%,印证了其核分布的均匀离散特性。这些差异具有统计学显著性,为拓扑特征诊断价值提供了实证支持。
阈值敏感性分析
特征表现呈现明显阈值依赖性:低阈值时β0差异最显著,而高阈值更利于β1的肿瘤鉴别。100像素阈值在保持结构稳定性与区分度间取得最佳平衡,经FDR校正后仍保持p<0.05的显著性水平。
Discussion
该研究首次将Betti数应用于早期RCC检测,其创新性体现在三方面:一是发现β1对微环境改变的敏感性,这与肿瘤细胞突破基底膜的生物过程高度吻合;二是建立强度阈值与拓扑特征的量化关系,解决了既往研究中阈值选择的主观性问题;三是开发的计算框架仅需常规H&E染色切片,具备临床转化可行性。
Conclusion
研究证实拓扑和图论特征能客观反映RCC特异的核空间重组模式,其诊断效能不逊于复杂深度学习模型。更深远的意义在于,这种可解释的计算病理学方法为理解肿瘤异质性提供了新视角——核聚集的拓扑特征可能对应特定分子通路异常,未来或可成为预后预测的生物标志物。随着精准医学发展,这种融合数学与病理学的研究范式,有望推动癌症诊断从形态描述向定量拓扑分析的范式转变。
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